Evidence of rapid non-targeted effects of cycloheximide on soil bacteria using <sup>13</sup>C-PLFA analysis
Notice bibliographique
Résumé
Stable isotope probing of phospholipid fatty acids (PLFA-SIP) is useful when studying bacterial contributions to soil processes, and it is an effective way to separate fungal and bacterial activity by linking 13C enrichment to specific PLFAs. Distinguishing bacterial contributions to soil processes often employs selective inhibitors; however, studies demonstrating their efficacy when using PLFA-SIP are less common. Here, we determined the effect of the fungal inhibitor cycloheximide (4.8 mg g−1 dry soil) and the bacterial inhibitor bronopol (0.48 mg g−1 dry soil) on microbial communities white spruce [Picea glauca (Moench) Voss] forest floor by measuring the uptake of 13C-enriched glucose (2 mg g−1 dry soil) in microbial PLFAs. We targeted [13C]glucose uptake by the bacterial community conditioned to a stable soil environment of 23 °C for over 2 wk rather than new bacteria generated from active colony growth caused by glucose addition. Nearly all bacterial PLFAs exhibited pronounced inhibition of 13C enrichment in the presence of bronopol. Limited inhibition of 13C enrichment in the presence of cycloheximide was observed as bacterial PLFA affected by cycloheximide had roughly one third less 13C enrichment than samples emended with [13C]glucose alone. Inhibitory effects only reduced 13C enrichment and did not affect total PLFA concentrations, implying that the inhibitors in the concentrations applied were impeding bacterial activity without causing cell death. Based on this work, we conclude that bronopol is an effective inhibitor for bacteria. Additionally, non-targeted effects of cycloheximide on soil bacteria must be accounted for when it is used in soil incubations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».