MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3044750471 · doi:10.1101/2020.07.26.221937

Quorum Sensing Regulates ‘swim-or-stick’ Lifestyle in the Phycosphere

2020· preprint· en· W3044750471 sur OpenAlexfundno aff
Cong Fei, Michael A. Ochsenkühn, Ahmed A. Shibl, Ashley Isaac, Changhai Wang, Shady A. Amin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork UniversityNew York University Abu Dhabi
Mots-clésQuorum sensingRoseobacterBiofilmBiologyBacteriaMarine bacteriophageDiatomProkaryoteChemotaxisMicrobiologyCell biologyEcologyGeneGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Originality-significance statement Motility and biofilm formation are processes regulated by quorum sensing (QS) in bacteria. Both functions are believed to play an important role in interactions between bacteria and phytoplankton. Here, we show that two bacterial symbionts from the microbial community associated with a ubiquitous diatom switch their motile lifestyle to attached cells while an opportunist bacterium from the same community is incapable of attachment, despite possessing the genetic machinery to do so. Further work indicated that the opportunist lacks QS signal synthases while the symbionts produce three QS signals, one of which is mainly responsible for regulating symbiont colonization of the diatom microenvironment. These findings suggest that QS regulates colonization of diatom surfaces and further work on these model systems will inform our understanding of particle aggregation and bacterial attachment to marine snow and how these processes influence the global carbon cycle. Summary Interactions between phytoplankton and bacteria play major roles in global biogeochemical cycles and oceanic nutrient fluxes. These interactions occur in the microenvironment surrounding phytoplankton cells, known as the phycosphere. Bacteria in the phycosphere use either chemotaxis or attachment to benefit from algal excretions. Both processes are regulated by quorum sensing (QS), a cell-cell signaling mechanism that uses small infochemicals to coordinate bacterial gene expression. However, the role of QS in regulating bacterial attachment in the phycosphere is not clear. Here, we isolated a Sulfitobacter pseudonitzschiae F5 and a Phaeobacter sp. F10 belonging to the marine Roseobacter group and an Alteromonas macleodii F12 belonging to Alteromonadaceae, from the microbial community of the ubiquitous diatom Asterionellopsis glacialis. We show that only the Roseobacter group isolates (diatom symbionts) can attach to diatom transparent exopolymeric particles. Despite all three bacteria possessing genes involved in motility, chemotaxis, and attachment, only S. pseudonitzschiae F5 and Phaeobacter sp. F10 possessed complete QS systems and could synthesize QS signals. Using UHPLC-MS/MS, we identified three QS molecules produced by both bacteria of which only 3-oxo-C 16:1 -HSL strongly inhibited bacterial motility and stimulated attachment in the phycosphere. These findings suggest that QS signals enable colonization of the phycosphere by algal symbionts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetMicrobial Community Ecology and Physiology→Travaux en français237 207→