Systematic Review of Fecal and Mucosa-Associated Microbiota Compositional Shifts in Colorectal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Gut microbiota is a major component of the intestinal luminal environment and plays important roles in colorectal cancer. Object: systematically review all the existing literature on the association of mucosa-associated and fecal microbiota with incidence, location, and stage of colorectal adenoma and carcinoma. Methods: The scientific search was done up to July 2018. The search was limited to the English language with predefined and proper keywords. Among 616 articles some of them were eliminated due to some reasons. The inclusion and exclusion criteria were defined. In the next step two reviewers (M.M and Z.K) independently scanned the titles of all retrieved articles, removed duplicates, and identified potentially relevant abstracts for further assessment. The Newcastle-Ottawa Scale (NOS) for assessing the Quality was used for quality control. Result: Finally, 54 articles were entered into the study. Fusobacteria 39 (72%), Firmicutes 22(40%), Bacteroidetes 20 (37%), Proteobacteria 15(27%), Actinobacteria 10(18%) was the most prevalent phylum which was found in colorectal cancer patients. Among these taxa some of them were increased in colorectal cancer patients compared to the control; on the other hand, some taxon was declined in colorectal cancer patients. Besides this, in some taxon there were controversies among articles. Conclusion: Early detection of CRC is essential because patients whose cancer are detected at an early stage have more chance of survival. Until now there are several studies have demonstrated the potential rule of gut microbiota to be used for detection of CRC, but there is not any predefining protocol for screening. Although we found lots of articles which were published in this area, for defining a precise microbiota profile we need large multicenter case-control studies, where can show the effect of most important confounding factors like nutrition, ethnicity, physical activity, smoking consumption, and genetic background.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,036 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,010 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,017 | 0,015 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».