MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3045281070 · doi:10.1016/j.ajhg.2020.06.015

Bi-allelic HPDL Variants Cause a Neurodegenerative Disease Ranging from Neonatal Encephalopathy to Adolescent-Onset Spastic Paraplegia

2020· article· en· W3045281070 sur OpenAlexaff
Ralf A. Husain, Mona Grimmel, Matias Wagner, J. Christopher Hennings, Christian Marx, René G. Feichtinger, Abdelkrim Saadi, Kevin Rostásy, Florentine Radelfahr, Andrea Bevot, Marion Döbler‐Neumann, Hans Hartmann, Laurence Colleaux, Isabell Cordts, Xenia Kobeleva, Hossein Darvish, Somayeh Bakhtiari, Michael C. Kruer, Arnaud Besse, Andy Cheuk‐Him Ng, Diana Chiang, François V. Bolduc, Abbas Tafakhori, Shrikant Mane, Saghar Ghasemi Firouzabadi, Antje K. Huebner, Rebecca Buchert, Stefanie Beck‐Woedl, Amelie J. Müller, Lucia Laugwitz, Thomas Nägele, Zhao‐Qi Wang, Tim M. Strom, Marc Sturm, Thomas Meitinger, Thomas Klockgether, Olaf Rieß, Thomas Klopstock, Ulrich Brandl, Christian A. Hübner, Marcus Deschauer, Johannes A. Mayr, Penelope E. Bonnen, Ingeborg Krägeloh‐Mann, Saskia B. Wortmann, Tobias B. Haack

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthBundesministerium für Bildung und ForschungRadboud Universitair Medisch CentrumCosmetic Surgery FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftE-Rare
Mots-clésMedicineSpasticParaplegiaAlleleHereditary spastic paraplegiaEncephalopathyDiseaseCerebral palsyPediatricsBiologyGeneticsInternal medicinePhysical therapyPsychiatryPhenotypeGeneSpinal cord

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report bi-allelic pathogenic HPDL variants as a cause of a progressive, pediatric-onset spastic movement disorder with variable clinical presentation. The single-exon gene HPDL encodes a protein of unknown function with sequence similarity to 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase. Exome sequencing studies in 13 families revealed bi-allelic HPDL variants in each of the 17 individuals affected with this clinically heterogeneous autosomal-recessive neurological disorder. HPDL levels were significantly reduced in fibroblast cell lines derived from more severely affected individuals, indicating the identified HPDL variants resulted in the loss of HPDL protein. Clinical presentation ranged from severe, neonatal-onset neurodevelopmental delay with neuroimaging findings resembling mitochondrial encephalopathy to milder manifestation of adolescent-onset, isolated hereditary spastic paraplegia. All affected individuals developed spasticity predominantly of the lower limbs over the course of the disease. We demonstrated through bioinformatic and cellular studies that HPDL has a mitochondrial localization signal and consequently localizes to mitochondria suggesting a putative role in mitochondrial metabolism. Taken together, these genetic, bioinformatic, and functional studies demonstrate HPDL is a mitochondrial protein, the loss of which causes a clinically variable form of pediatric-onset spastic movement disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueThe American Journal of Human Genetics→Même sujetNeurological diseases and metabolism→Travaux en français237 207→