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Enregistrement W3045566113 · doi:10.1021/acs.analchem.0c02815

Multimodal Imaging Mass Spectrometry to Identify Markers of Pulmonary Arterial Hypertension in Human Lung Tissue Using MALDI-ToF, ToF-SIMS, and Hybrid SIMS

2020· article· en· W3045566113 sur OpenAlexaff
Sebastiaan Van Nuffel, Marceau Quatredeniers, Alexander Pirkl, Julia Zakel, Jean‐Pierre Le Caër, Nicolas Elie, Quentin Vanbellingen, Sébastien J. Dumas, Morad K. Nakhleh, Maria‐Rosa Ghigna, Élie Fadel, Marc Humbert, Pierre Chaurand, David Touboul, Sylvia Cohen‐Kaminsky, Alain Brunelle

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAssistance publique-Hôpitaux de ParisInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleLaboratoire d'Excellence en Recherche sur le Médicament et l'Innovation ThérapeutiqueUniversité Paris-SudAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésChemistryMass spectrometry imagingMass spectrometryMatrix-assisted laser desorption/ionizationLungChromatographyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a rare and deadly disease affecting roughly 15–60 people per million in Europe with a poorly understood pathology. There are currently no diagnostic tools for early detection nor does a curative treatment exist. The lipid composition of arteries in lung tissue samples from human PAH and control patients were investigated using matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) imaging mass spectrometry (IMS) combined with time-of-flight secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS) imaging. Using random forests as an IMS data analysis technique, it was possible to identify the ion at m/z 885.6 as a marker of PAH in human lung tissue. The m/z 885.6 ion intensity was shown to be significantly higher around diseased arteries and was confirmed to be a diacylglycerophosphoinositol PI(C18:0/C20:4) via MS/MS using a novel hybrid SIMS instrument. The discovery of a potential biomarker opens up new research avenues which may finally lead to a better understanding of the PAH pathology and highlights the vital role IMS can play in modern biomedical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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