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Enregistrement W3045602149 · doi:10.1093/pcp/pcaa100

Functional Characterization of Terpene Synthases Accounting for the Volatilized-Terpene Heterogeneity in Lathyrus odoratus Cultivar Flowers

2020· article· en· W3045602149 sur OpenAlexaff
Tingting Bao, Shadrack Kimani, Yang Song, Xinxin Xue, Shuying Li, Ning Wang, Qiuyue Wang, Li Wang, Xiang Gao, Quentin Cronk

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesChina Postdoctoral Science FoundationDepartment of Science and Technology of Jilin ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLinaloolTerpeneGeraniolBiologyTerpenoidSesquiterpeneBotanyLathyrusNerolidolFabaceaeBiochemistryEssential oil

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lathyrus odoratus (sweet pea) is an ornamental plant with exceptional floral scent, previously used as an experimental organism in the early development of Mendelian genetics. However, its terpene synthases (TPSs), which act as metabolic gatekeepers in the biosynthesis of volatile terpenoids, remain to be characterized. Auto-Headspace Solid-phase Microextraction/Gas chromatography-mass spectrometry analysis of floral volatile terpene constituents from seven sweet pea cultivars identified α-bergamotene, linalool, (-)-α-cubebene, geraniol, β-caryophyllene and β-sesquiphellandrene as the dominant compounds. RNA sequencing was performed to profile the transcriptome of L. odoratus flowers. Bioinformatic analysis identified eight TPS genes (acronymed as LoTPS) that were successfully cloned, heterologously expressed and functionally analyzed. LoTPS4 and LoTPS7, belonging to the TPS-b clade, biochemically catalyzed the formation of monoterpenes and sesquiterpenes. LoTPS3 and LoTPS8, placed in the TPS-a clade, also generated monoterpenes and sesquiterpenes, while LoTPS12 belonging to the TPS-g clade showed linalool/nerolidol synthase activity. Notably, biochemical assays of the recombinant LoTPS proteins revealed their catalytic promiscuity, and the enzymatic products were basically consistent with major volatile compounds released from sweet pea flowers. The data from our study lay the foundation for the chemical ecology, molecular genetics and biotechnological improvement of sweet pea and other legumes (Fabaceae).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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