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Enregistrement W3045803335 · doi:10.1101/2020.07.28.20163873

Determining the period of communicability of SARS-CoV-2: A rapid review of the literature

2020· review· en· W3045803335 sur OpenAlexaff
Mina Park, Colleen Pawliuk, Tribesty Nguyen, Amanda Griffitt, Linda Dix‐Cooper, Nadia Fourik, Martin Dawes

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésViral sheddingIsolation (microbiology)Transmission (telecommunications)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyViral loadCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirusBiologyMedicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)BioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction How long individuals may transmit virus after infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is unclear. Understanding the communicability period of SARS-CoV-2 is important to inform the period of isolation required to prevent nosocomial and community spread. The objective of this study was to identify the reported communicable period of SARS-CoV-2, based on a rapid review of existing literature. Methods Studies reporting empirical data on the period of communicability of SARS-CoV-2 through investigations of duration of communicability based on in-person contact (“contact transmission”), isolation and culture of virus (“viral isolation”), and viral shedding by detection of nucleic acids by RT-PCR (“viral shedding”) were identified through searches of peer-reviewed and pre-print health sciences literature databases (Ovid MEDLINE, Embase, Google Scholar, medRxiv and arXiv) and the grey literature. Articles were screened for relevance, then data were extracted, analyzed, and synthesized. Results Out of the 165 studies included for qualitative analysis, one study investigated contact transmission, three investigated viral isolation, 144 investigated viral shedding, and 17 studies focused on both viral shedding and viral isolation. The median length of time until viral clearance across all viral isolation studies was nine days; however, the maximum identified duration was 32 days. Studies with data on both viral isolation and viral shedding showed a prolonged maximum time until viral clearance for viral shedding (9 days vs 24 days). Discussion Findings from this review support a minimum 10-day period of isolation; however, additional observation should be considered for individuals being released into high-risk settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,722
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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