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Refined cut-off for TP53 immunohistochemistry improves prediction of TP53 mutation status in ovarian mucinous tumors: implications for outcome analyses
Eun Young Kang, Dane Cheasley, Cécile Le Page, Matthew J. Wakefield, Michelle da Cunha Torres, Simone M. Rowley, Carolina Salazar, Zhongyue Xing, Prue E. Allan, David D.L. Bowtell, Anne‐Marie Mes‐Masson, Diane Provencher, Kurosh Rahimi, Linda E. Kelemen, Peter A. Fasching, Jennifer A. Doherty, Marc T. Goodman, Ellen L. Goode, Suha Deen, Paul D.P. Pharoah, James D. Brenton, Weiva Sieh, Constantina Mateoiu, Karin Sundfeldt, Linda S. Cook, Nhu D. Le, Michael S. Anglesio, C. Blake Gilks, David G. Huntsman, Catherine J. Kennedy, Nadia Traficante, Georgia Chenevix‐Trench, A. Green, Penelope M. Webb, Anna DeFazio, Dorota M. Gertig, Sián Fereday, Suzanne Moore, Jillian A. Hung, K.R. Harrap, T. Sadkowsky, Nirmala Pandeya, M. Malt, A. Mellon, R. Paul Robertson, T. Vanden Bergh, Michael E. Jones, P. Mackenzie, J. Maidens, K. Nattress, Yoke-Eng Chiew, Annie Stenlake, Harold C. Sullivan, Barbara D. Alexander, P. Ashover, Stephen M. Brown, T. Corrish, L. Green, L. M. Jackman, Kaltin Ferguson, Karla Martin, A. Martyn, B. Ranieri, Jeff White, V. Jayde, Pam Mamers, Leanne Bowes, Laura Galletta, Daniel A. Giles, Joy Hendley, Kathryn Alsop, Tannin A. Schmidt, H. Shirley, C. Ball, Christian D. Young, S. Viduka, Hoa Tran, Sanela Bilic, Lydia Glavinas, Julia Brooks, R. Stuart‐Harris, Fred Kirsten, J Rutovitz, P. Clingan, Akisha Glasgow, Anthony Proietto, Stephen Braye, Geoffrey Otton, Jenny Shannon, Tony Bonaventura, Jocelyn M. Stewart, Stephen Begbie, Michael Friedländer, Debra Bell, Sally Baron‐Hay, A. Ferrier, G. Gard, David Nevell, Nick Pavlakis, Susan Valmadre, B. Young, C. Camaris, R. Crouch, L. Edwards, Neville F. Hacker, Donald E. Marsden, Gregory Robertson, Philip Beale, Jane Beith, J. Carter, C. Dalrymple, R. Houghton, Prudence A. Russell, Matthew Links, John J. Grygiel, Jane Hill, Alison H. Brand, Karen Byth, Richard Jaworski, Paul R. Harnett, R. Sharma, Gerard Wain, B. Ward, D. Papadimos, A. Crandon, Michael P. Cummings, K. Horwood, Andreas Obermair, Lewis Perrin, David Wyld, James Nicklin, Marcus Davy, Martin K. Oehler, Cathrine Hall, Tom Dodd, Timothy M. Healy, Keir Pittman, D C Henderson, J. Miller, J. Pierdes, Penny Blomfield, D. Challis, Rachel McIntosh, Alyssa Parker, Robert Brown, Robert Rome, Digby Allen, Peter Grant, Simon Hyde, R. Laurie, Melissa Robbie, D. Healy, Tom Jobling, T. Manolitsas, J. McNealage, Peter A. W. Rogers, B. Susil, E. Sumithran, Ian Simpson, Kelly‐Anne Phillips, Danny Rischin, Stephen B. Fox, Daryl Johnson, Stephen Lade, Maurice B. Loughrey, N. O’Callaghan, William K. Murray, Paul Waring, Virginia Billson, Jan Pyman, Deborah Neesham, Michael Quinn, Craig Underhill, Rachel Bell, L. F. Ng, Robert Blum, Vinod Ganju, Ian Hammond, Yee Leung, Anthony J. McCartney, Martin Buck, I. Haviv, D. Purdie, David C. Whiteman, Nikolajs Zeps, Scott H. Kaufmann, Michael Churchman, Charlie Gourley, Andrew N. Stephens, Nicola S. Meagher, Susan J. Ramus, Yoland Antill, Ian Campbell, Clare L. Scott, Martin Köbel, Kylie L. Gorringe, Georgina L. Ryland, Sumitra Ananda, George Au‐Yeung, Maret Böhm, Michael Christie, Yoke-Eng Chiew, Rhiannon Dudley, Nicole Fairweather, Alison Hadley, Gwo‐Yaw Ho, Sally M. Hunter, Kimberly R. Kalli, Orla McNally, Jessica N. McAlpine, Linda Mileshkin, Goli Samimi
Notice bibliographique
RevueModern Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British ColumbiaCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Cancer InstituteCancer Council TasmaniaCancer Council VictoriaTerry Fox Research InstituteCancer Institute NSWCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthBC Cancer FoundationCancer Council South AustraliaUniversité de MontréalCancer AustraliaNational Institute for Health and Care ResearchNational Health and Medical Research CouncilUniversity of CambridgeMinnesota Ovarian Cancer AllianceHuntsman Cancer FoundationCancer Research UKMichael Smith Health Research BCMayo Foundation for Medical Education and ResearchCancer Council NSWOvarian Cancer AustraliaMarshfield Clinic Research FoundationVictorian Cancer AgencyFred C. and Katherine B. Andersen FoundationMedical Research CouncilPeter MacCallum FoundationCancer Research SocietySwedish Cancer Foundation
Mots-clésTissue microarrayImmunohistochemistryConcordancePathologyMedicineOvarian cancerOncologyCohortAnatomical pathologyInternal medicineBiologyCancer
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,036
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations41
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentnon