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Enregistrement W3046419233 · doi:10.1136/bmjdrc-2019-001113

Characterization of the renal cortical transcriptome following Roux-en-Y gastric bypass surgery in experimental diabetic kidney disease

2020· article· en· W3046419233 sur OpenAlexfundno aff
Meera G. Nair, William P. Martin, Vadim Zhernovkov, Jessie A. Elliott, Naomi Fearon, Hans‐Georg Eckhardt, Janet McCormack, Catherine Godson, Eoin Brennan, Mariam Marai, Lars Fändriks, Neil G. Docherty, Carel W. le Roux

Notice bibliographique

RevueBMJ Open Diabetes Research & Care · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilGöteborgs UniversitetEuropean Foundation for the Study of DiabetesVetenskapsrådetScience Foundation IrelandSahlgrenska AkademinHealth Research BoardHealth Service ExecutiveWellcome TrustCanadian Institute for Theoretical Astrophysics
Mots-clésMedicineDiabetes mellitusKidneyGastric bypassGastric bypass surgeryDiseaseTranscriptomeSurgeryInternal medicineEndocrinologyObesityGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Roux-en-Y gastric bypass surgery (RYGB) reduces albuminuria and the long-term incidence of end-stage renal disease in patients with obesity and diabetes. Preclinical modeling in experimental diabetic kidney disease demonstrates that improvements in glomerular structure likely underpin these findings. RESEARCH DESIGN AND METHODS: In adult male Zucker diabetic fatty (ZDF) rats, we profiled the effect of RYGB on weight and metabolic control as well biochemical, structural and ultrastructural indices of diabetic renal injury. Furthermore, we sequenced the renal cortical transcriptome in these rats and used bioinformatic pathway analyses to characterize the transcriptional alterations governing the renal reparative response to RYGB. RESULTS: In parallel with improvements in weight and metabolic control, RYGB reduced albuminuria, glomerulomegaly, podocyte stress and podocyte foot process effacement. Pathway analysis of RYGB-induced transcriptomic changes in the renal cortex highlighted correction of disease-associated alterations in fibrosis, inflammation and biological oxidation pathways. RYGB reversed disease-associated changes in the expression of transforming growth factor (TGF)-β superfamily genes that strongly correlated with improvements in structural measures of glomerulopathy. CONCLUSIONS: Improved glomerular structure in ZDF rats following RYGB is underpinned by pathway level changes, including interruption of the TGF-β-driven early profibrotic programme. Our data provide an important layer of experimental support for clinical evidence demonstrating that RYGB arrests renal damage in patients with obesity and type 2 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,283
Score d'incertitude au seuil0,807

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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