Results from the WHO external quality assessment for the respiratory syncytial virus pilot, 2016‐17
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: External quality assessments (EQAs) for the molecular detection of respiratory syncytial virus (RSV) are necessary to ensure the provision of reliable and accurate results. One of the objectives of the pilot of the World Health Organization (WHO) Global RSV Surveillance, 2016-2017, was to evaluate and standardize RSV molecular tests used by participating countries. This paper describes the first WHO RSV EQA for the molecular detection of RSV. METHODS: The WHO implemented the pilot of Global RSV Surveillance based on the WHO Global Influenza Surveillance and Response System (GISRS) from 2016 to 2018 in 14 countries. To ensure standardization of tests, 13 participating laboratories were required to complete a 12 panel RSV EQA prepared and distributed by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC), USA. The 14th laboratory joined the pilot late and participated in a separate EQA. Laboratories evaluated a RSV rRT-PCR assay developed by CDC and compared where applicable, other Laboratory Developed Tests (LDTs) or commercial assays already in use at their laboratories. RESULTS: Laboratories performed well using the CDC RSV rRT-PCR in comparison with LDTs and commercial assays. Using the CDC assay, 11 of 13 laboratories reported correct results. Two laboratories each reported one false-positive finding. Of the laboratories using LDTs or commercial assays, results as assessed by Ct values were 100% correct for 1/5 (20%). With corrective actions, all laboratories achieved satisfactory outputs. CONCLUSIONS: These findings indicate that reliable results can be expected from this pilot. Continued participation in EQAs for the molecular detection of RSV is recommended.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,082 | 0,040 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».