MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3046579681 · doi:10.1371/journal.pone.0236507

Cellular oxygen consumption, ROS production and ROS defense in two different size-classes of an Amazonian obligate air-breathing fish (Arapaima gigas)

2020· article· en· W3046579681 sur OpenAlexaff
Bernd Pelster, Chris M. Wood, Derek Felipe Campos, Adalberto Luís Val

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasCiência sem FronteirasConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésGillBiologyReactive oxygen speciesOxygenObligateKidneyCell biologyMetabolismBiochemistryEcologyChemistryFish <Actinopterygii>FisheryEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In air-breathing fish a reduction of gill surface area reduces the danger of losing oxygen taken up in the air-breathing organ (ABO) to hypoxic water, but it also reduces the surface area available for ion exchange, so that ion regulation may at least in part be transferred to other organs, like the kidney or the gut. In the air-breathing Arapaima gigas, gill lamellae regress as development proceeds, and starting as a water-breathing embryo Arapaima turns into an obligate air-breathing fish with proceeding development, suggesting that ion regulation is shifted away from the gills as the fish grows. In Arapaima the kidney projects medially into the ABO and thus, probably a unique situation among fishes, is in close contact to the gas of the ABO. We therefore hypothesized that the kidney would be predestined to adopt an increased importance for ion homeostasis, because the elevated ATP turnover connected to ion transport can easily be met by aerobic metabolism based on the excellent oxygen supply directly from the ABO. We also hypothesized that in gill tissue the reduced ion regulatory activity should result in a reduced metabolic activity. High metabolic activity and exposure to high oxygen tensions are connected to the production of reactive oxygen species (ROS), therefore the tissues exposed to these conditions should have a high ROS defense capacity. Using in vitro studies, we assessed metabolic activity and ROS production of gill, kidney and ABO tissue, and determined the activity of ROS degrading enzymes in small (~ 5g, 2-3 weeks old) and larger (~ 670 g, 3-4 months old) A. gigas. Comparing the three tissues revealed that kidney tissue oxygen uptake by far exceeded the uptake measured in gill tissue or ABO. ROS production was particularly high in gill tissue, and all three tissues had a high capacity to degrade ROS. Gill tissue was characterized by high activities of enzymes involved in the glutathione pathway to degrade ROS. By contrast, the tissues of the ABO and in particular the kidney were characterized by high catalase activities, revealing different, tissue-specific strategies in ROS defense in this species. Overall the differences in the activity of cells taken from small and larger fish were not as pronounced as expected, while at the tissue level the metabolic activity of kidney cells by far exceeded the activity of ABO and gill cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONE→Même sujetPhysiological and biochemical adaptations→Travaux en français237 207→