Gut Microenvironment and Bacterial Invasion in Paediatric Inflammatory Bowel Diseases
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Host-microbial relationship is disrupted in inflammatory bowel diseases (IBD). We hypothesized that altered gut luminal microenvironment can impact microbial virulence in IBD, leading to disruption of homeostasis and disease. We investigated the relationship between gut microenvironment and microbial virulence. METHODS: Intestinal aspirates were collected from 10 non-IBD controls, 9 Crohn disease, and 10 ulcerative colitis paediatric patients during endoscopy. In vitro invasion of bacteria isolated from the duodenum and terminal ileum (TI) was quantified using gentamicin protection assays. Intestinal epithelial cells were infected in vitro by known Escherichia coli strains with patient intestinal aspirates added. Nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR) analysis was conducted on intestinal aspirates to identify metabolites associated with invasion; these metabolites were then introduced to the infection model. RESULTS: There was no difference in in vitro invasion of bacteria obtained from intestinal aspirates of non-IBD and IBD patients. Incubation of laboratory E coli strains with TI aspirates from IBD patients increased their invasion into epithelial cells in vitro. NMR analysis revealed intestinal metabolites that correlated with bacterial invasion; succinate present in the intestinal aspirates correlated positively, whereas acetate and formate related negatively with invasion. Addition of exogenous succinate increased invasion of E coli in vitro. CONCLUSIONS: Alterations in the gut microenvironment in IBD can affect bacterial invasion. Succinate is associated with increased bacterial invasion and can alter bacterial virulence in IBD. This highlights the interaction between specific metabolites and bacteria that could be instrumental in propagating or suppressing inflammation in paediatric IBD patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».