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Enregistrement W3046630186 · doi:10.1007/s40484-020-0212-7

Germline genomes have a dominant‐heritable contribution to cancer immune evasion and immunotherapy response

2020· article· en· W3046630186 sur OpenAlexaff
Xue Jiang, Mohammad Asad, Lin Li, Zhanpeng Sun, Jean‐Sébastien Milanese, Bo Liao, Edwin Wang

Notice bibliographique

RevueQuantitative Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemBiologyGermlineImmunotherapyCancer immunotherapyCancerGermline mutationImmunologyEvasion (ethics)Immune checkpointGeneticsCancer researchMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Immune evasion is a fundamental hallmark for cancer. At the early stages of tumor development, immune evasion strategies must be implemented by tumors to prevent attacks from the host immune systems. Blocking tumors’ immune evasion will re‐activate the host immune systems to eliminate tumors. Immune‐checkpoint therapy (ICT) which applies anti‐PD‐1/PD‐L1 or anti‐CTLA4 treatment has been a remarkable success in the past few years. However, ~70% of patients cannot gain any clinical benefits from ICT treatment due to the tumor‐immunity system’s complexity. In the past, germline pathogenic variants have been thought to have only minor‐heritable contributions to cancer. Results Emerging evidence has shown that germline genomes play a dominant‐heritable contribution to cancer via encoding the host immune system. The functional components of the immune system are encoded by the host genome, thus the germline genome might have a profound impact on cancer immune evasion and immunotherapy response. Indeed, recent studies showed that germline pathogenic variants can influence immune capacity in cancer patients at a population level by (i) shaping tumor somatic mutations, altering methylation patterns and antigen‐presentation capacity or (ii) influencing NK cell’s function to modulate lymphocyte infiltration in the tumor microenvironment. In addition, the HLA (types A, B or C) genotypes also shape the landscape of tumor somatic mutations. Conclusion These results highlight the indispensable roles of germline genome in immunity and cancer development and suggest that germline genomics should be integrated into the research field of cancer biology and cancer immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,696
Score d'incertitude au seuil0,621

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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