Antimicrobial‐Resistant <i>Streptococcus pneumoniae</i> in Canadian Hospitals: Results from the 2007 CANWARD Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Canadian Ward Surveillance Study (CANWARD 2007) tested isolates collected from January to December 2007 from 12 Canadian hospitals to a range of antimicrobial agents. The present paper focuses on antimicrobial resistance in Streptococcus pneumoniae in Canadian hospitals, with an emphasis on macrolide resistance. MEtHODS: Minimum inhibitory concentrations of antimicrobial agents were determined using the broth microdilution method and interpreted according to Clinical and Laboratory Standards Institute breakpoints. Macrolide‐nonsusceptible strains (clarithromycin minimum inhibitory concentrations 0.5 μg/mL or greater) were analyzed by multiplex polymerase chain reaction for the presence of mefA and ermB genes. RESULTS: S pneumoniae represented 9.0% (706 of 7881) of all isolates collected in CANWARD 2007. Of the 706 S pneumoniae isolates collected, 33.1% (234) were from blood and 66.9% (472) were from respiratory specimens. The overall resistance (resistant and intermediate) rates for S pneumoniae isolated from respiratory and blood specimens, respectively, were: penicillin (23.9%, 14.4%), clarithromycin (22.1%, 12.6%), trimethoprim‐sulfamethoxazole (14.7%, 11.5%), doxycycline (7.8%, 5.1%) and clindamycin (7.1%, 3.3%). Multidrug resistance (resistance to penicillin, clarithromycin and trimethoprimsulfamethoxazole) accounted for 2% (n=9) and 0.5% (n=1) of respiratory and blood isolates, respectively. Susceptibility of 95% or greater was found with amoxicillin‐clavulanic acid (99.5%, 99.3%), ceftriaxone (99.5%, 100%), cefuroxime (95.0%, 96.8%), ertapenem (99.8%, 100%), meropenem (96.1%, 99.5%) and levofloxacin (99.1%, 100%) for respiratory and blood specimens, respectively. No resistance to vancomycin, tigecycline, cethromycin or telithromycin was found. mefA was present in 53.6% (52 of 97) of respiratory and 59.3% (16 of 27) of blood macrolide‐nonsusceptible S pneumoniae, while ermB was present in 38.1% (37 of 97) of respiratory and 37% (10 of 27) of blood isolates. Eight of 97 (8.2%) respiratory and one of 27 (3.7%) blood isolates contained both mefA and ermB genes. CONCLUSIONS: S pneumoniae is a common organism isolated from clinical specimens in Canadian hospitals. Resistance was highest to penicillin and clarithromycin, while ceftriaxone and levofloxacin susceptibility were both greater than 99%. No isolates resistant to vancomycin, tigecycline, linezolid or the ketolides were found. Resistance rates were higher among respiratory tract isolates of S pneumoniae than among blood isolates. Macrolide efflux, mefA, was the predominant mechanism of macrolide resistance among both respiratory and blood clarithromycin‐nonsusceptible isolates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».