A Visual Analytics Framework for Contrastive Network Analysis
Notice bibliographique
Résumé
A common network analysis task is comparison of two networks to identify unique characteristics in one network with respect to the other. For example, when comparing protein interaction networks derived from normal and cancer tissues, one essential task is to discover protein-protein interactions unique to cancer tissues. However, this task is challenging when the networks contain complex structural (and semantic) relations. To address this problem, we design ContraNA, a visual analytics framework leveraging both the power of machine learning for uncovering unique characteristics in networks and also the effectiveness of visualization for understanding such uniqueness. The basis of ContraNA is cNRL, which integrates two machine learning schemes, network representation learning (NRL) and contrastive learning (CL), to generate a low-dimensional embedding that reveals the uniqueness of one network when compared to another. ContraNA provides an interactive visualization interface to help analyze the uniqueness by relating embedding results and network structures as well as explaining the learned features by cNRL. We demonstrate the usefulness of ContraNA with two case studies using real-world datasets. We also evaluate through a controlled user study with 12 participants on network comparison tasks. The results show that participants were able to both effectively identify unique characteristics from complex networks and interpret the results obtained from cNRL.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,004 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».