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Enregistrement W3046872262 · doi:10.1101/2020.07.31.230185

A collaborative resource platform for non-human primate neuroimaging

2020· preprint· en· W3046872262 sur OpenAlexaff
Adam Messinger, Nikoloz Sirmpilatze, Katja Heuer, Kep Kee Loh, Rogier B. Mars, Julien Sein, Ting Xu, Daniel Glen, Benjamin Jung, Jakob Seidlitz, Paul A. Taylor, Roberto Toro, Eduardo A. Garza‐Villarreal, Caleb Sponheim, Xindi Wang, R. Austin Benn, Bastien Cagna, Rakshit Dadarwal, HC Evrard, Pamela García-Saldivar, Steven Giavasis, Renée Hartig, Claude Lepage, Cirong Liu, Piotr Majka, Hugo Merchant, Michael P. Milham, Marcello G. P. Rosa, Jordy Tasserie, Lynn Uhrig, Daniel S. Margulies, P. Christiaan Klink

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthDirectorate for Biological SciencesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilFondation de FranceNational Institutes of HealthAgence Nationale de la RechercheWellcome Trust
Mots-clésNeuroimagingResource (disambiguation)Field (mathematics)Prime (order theory)PsychologyNon human primateComputer scienceData scienceNeuroscienceKnowledge managementBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuroimaging non-human primates (NHPs) is a growing, yet highly specialized field of neuroscience. Resources that were primarily developed for human neuroimaging often need to be significantly adapted for use with NHPs or other animals, which has led to an abundance of custom, in-house solutions. In recent years, the global NHP neuroimaging community has made significant efforts to transform the field towards more open and collaborative practices. Here we present the PRIMatE Resource Exchange (PRIME-RE), a new collaborative online platform for NHP neuroimaging. PRIME-RE is a dynamic community-driven hub for the exchange of practical knowledge, specialized analytical tools, and open data repositories, specifically related to NHP neuroimaging. PRIME-RE caters to both researchers and developers who are either new to the field, looking to stay abreast of the latest developments, or seeking to collaboratively advance the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,108

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0040,008
Science ouverte0,0040,017
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0270,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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