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Enregistrement W3046910449 · doi:10.1186/s12870-020-02566-2

RETRACTED ARTICLE: Contribution of anthocyanin pathways to fruit flesh coloration in pitayas

2020· article· en· W3046910449 sur OpenAlexaff
Ruiyi Fan, Qingming Sun, Jiwu Zeng, Xinxin Zhang

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifError by Third Party;Error in Data;Error in Results and/or Conclusions;
Date5/20/2021 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotanical Research and Applications
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnthocyaninFleshBiologyCyanidinCultivarDelphinidinTranscriptomeMetabolomePolyphenolBotanyBiochemistryMYBPigmentFood scienceGeneTranscription factorMetaboliteGene expressionChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Color formation in Hylocereus spp. (pitayas) has been ascribed to the accumulation of betalains. However, several studies have reported the presence of anthocyanins in pitaya fruit and their potential role in color formation has not yet been explored. In this study, we profiled metabolome and transcriptome in fruit of three cultivars with contrasting flesh colors (red, pink and white) to investigate their nutritional quality and the mechanism of color formation involving anthocyanins. RESULTS: Results revealed that pitaya fruit is enriched in amino acid, lipid, carbohydrate, polyphenols, vitamin and other bioactive components with significant variation among the three cultivars. Anthocyanins were detected in the fruit flesh and accumulation levels of Cyanidin 3-glucoside, Cyanidin 3-rutinoside, Delphinidin 3-O-(6-O-malonyl)-beta-glucoside-3-O-beta-glucoside and Delphinidin 3-O-beta-D-glucoside 5-O-(6-coumaroyl-beta-D-glucoside) positively correlated with the reddish coloration. Transcriptome data showed that the white cultivar tends to repress the anthocyanin biosynthetic pathway and divert substrates to other competing pathways. This perfectly contrasted with observations in the red cultivar. The pink cultivar however seems to keep a balance between the anthocyanin biosynthetic pathway and the competing pathways. We identified several active transcription factors of the MYB and bHLH families which can be further investigated as potential regulators of the anthocyanin biosynthetic genes. CONCLUSIONS: Collectively, our results suggest that anthocyanins partly contribute to color formation in pitaya fruit. Future studies aiming at manipulating the biosynthetic pathways of anthocyanins and betalains will better clarify the exact contribution of each pathway in color formation in pitayas. This will facilitate efforts to improve pitaya fruit quality and appeal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,105

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0310,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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