Reducing Read Time of Point-of-Care Test Does Not Affect Detection of Hepatitis C Virus and Reduces Need for Reflex RNA
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND & AIMS: Global elimination of hepatitis C virus (HCV) will require increases in diagnosis. Point of care (POC) tests that detect antibodies against HCV can be useful for testing large and difficult to reach populations. The most accurate POC test requires a 20 min read time to identify antibody-positive samples. We investigated whether viremic patients could be identified using a shorter read time, to increase efficiency and reduce the need for reflex tests (a follow-up test for HCV RNA on the same specimen to confirm viremia). METHODS: Patients with past or current HCV infections provided samples at 2 clinics in Canada for evaluation by the OraQuick HCV Rapid antibody POC test. A community HCV-screening program in Madrid, Spain (real-world cohort) invited people to be tested for HCV with the same OraQuick test. Patients provided samples of whole blood, via finger prick. Fingerprick samples were tested immediately after collection. In the clinic cohort, photographs of the developing test were taken at 15 second intervals, and blinded readers recorded the time to positivity. In the real-world cohort, readers recorded the OraQuick result at 5 minutes, and each minute after, up to 10 minutes, and then again at 20 minutes; viremia was then evaluated using a POC HCV RNA test (GeneXpert HCV Viral Load Assay). Sera from viremic and non-viremic clinic patients were used to quantify antibody titers to investigate the relationship between the time of band appearance and antibody concentration. Fisher's exact test and exact logistic regression were used to determine factors associated with a positive result at 5 minutes. RESULTS: Blood from all viremic patients produced a positive result in the antibody POC test by 5 min. Median time to a positive result for 171 viremic patients was 2.6 min (range, 1.8-4.6 min), vs 4.1 min (range, 2.3-14.4 min) for 108 patients with resolved infection (P < .001). The 5-min threshold identified all viremic cases among 176 HCV antibody-positive patients in the real-world cohort, confirmed by testing for HCV RNA. In the pooled cohorts, antibody positivity at 5 min identified viremic patients with 100% sensitivity (95% CI, 98.4%-100%); the negative predictive value was 100% (95% CI, 94.9%-100%). The positive predictive value at 5 min was 62.0% (95% CI, 56.7%-67.0%) and therefore insufficient alone to detect viremia; an HCV RNA test would still be necessary to confirm active infection. CONCLUSIONS: The wait time for the OraQuick HCV Rapid antibody POC blood test can be reduced from 20 min to 5 min and continue to reliably identify patients with HCV infection. Shortening the test time could increase high-throughput screening, reduce loss to follow up, and reduce the need for reflex HCV RNA testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».