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Enregistrement W3046997539 · doi:10.1039/d0mt00130a

A copper site is required for iron transport by the periplasmic proteins P19 and FetP

2020· article· en· W3046997539 sur OpenAlexafffund
Anson Chan, Helen Lin, Doreen Koch, Gregor Grass, Dietrich H. Nies, M.E.P. Murphy

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSLAC National Accelerator LaboratoryNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesWestern Economic Diversification CanadaBiological and Environmental ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchOffice of ScienceNational Institutes of HealthUniversity of SaskatchewanDeutsche ForschungsgemeinschaftU.S. Department of Energy
Mots-clésPeriplasmic spaceBiochemistryEscherichia coliATP7ABiologyTransport proteinChemistryBacterial outer membraneMicrobiologyCell biologyTransporter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni is a leading cause of food-borne gastrointestinal disease in humans and uropathogenic Escherichia coli is a leading cause of urinary tract infections. Both human pathogens harbour a homologous iron uptake system (termed cjFetM-P19 in C. jejuni and ecFetM-FetP in E. coli). Although these systems are important for growth under iron limitation, the mechanisms by which these systems function during iron transport remain undefined. The copper ions bound to P19 and FetP, the homologous periplasmic proteins, are coordinated in an uncommon penta-dentate manner involving a Met-Glu-His3 motif and exhibit positional plasticity. Here we demonstrate the function of the Met and Glu residues in modulating copper binding and controlling copper positioning through site-directed variants, binding assays, and crystal structures. Growth of C. jejuni strains with these p19 variants is impaired under iron limited conditions as compared to the wild-type strain. Additionally, an acidic residue-rich secondary site is required for binding iron and function in vivo. Finally, western blot analyses demonstrate direct and specific interactions between periplasmic P19 and FetP with the large periplasmic domain of their respective inner membrane transporters cjFetM and ecFetM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,781
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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