Abstract B23: EWS-FLI1 partners with EWSR1 to regulate transcription in Ewing sarcoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Transcription factors are important regulators in normal cell proliferation and cancer. Ewing sarcoma is a pediatric bone cancer driven by a translocation between two transcription factor genes, EWSR1 and FLI1, leading to the expression of an aberrant transcription factor, EWS-FLI1. While FLI1 is not expressed, constitutive expression of EWSR1 is retained in Ewing sarcoma cells. However, very little is known about the effect of wild-type EWSR1 on EWS-FLI1 transcriptional activity. EWSR1 and EWS-FLI1 coimmunoprecipitate in a complex together in Ewing sarcoma cells and HEK293T cells. RNA-sequencing in Ewing sarcoma cells revealed a pool of genes coregulated by EWS-FLI1 and EWSR1. Furthermore, loss of EWSR1 in Ewing sarcoma cells inhibits anchorage-independent growth. Taken together, this suggests EWSR1 may play a key role in the transcriptional activity of EWS-FLI1 in Ewing sarcoma biology. Citation Format: Nasiha Ahmed, Jacob Schwartz. EWS-FLI1 partners with EWSR1 to regulate transcription in Ewing sarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr B23.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,017 | 0,010 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».