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Enregistrement W3047087162 · doi:10.1158/1538-7445.pedca19-b68

Abstract B68: Spatial and temporal conditions for Smarcb1 deletion determines mouse AT/RT (atypical teratoid/rhabdoid tumor) subtype

2020· article· en· W3047087162 sur OpenAlexaboutno aff
Zhi‐Yan Han, Mamy Andrianteranagna, Maria Jesus-Lobon-Iglesias, Arnault Tauziède‐Espariat, Kévin Beccaria, Paul Fréneaux, Joshua J. Waterfall, Julien Masliah‐Planchon, Christine Bourneix, Gaëlle Pierron, Amaury Leruste, Céline Chauvin, Didier Surdez, Pascale Varlet, Christelle Dufour, Olivier Delattre, Volodia Dangouloff‐Ros, Franck Bourdeaut

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCB1BiologyConditional gene knockoutSMARCA4ImmunohistochemistryPhenotypeAtypical teratoid rhabdoid tumorPathologyStem cellNestinNeural stem cellCancer researchMedicineCell biologyGeneGene expressionImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The cell(s) of origin of AT/RTs remain(s) unknown. We previously developed a mouse model consisting of tamoxifen inducible system in a Smarcb1Flox/Flox;Rosa26-CreERT2 background. We obtained two molecular subgroups of intracranial tumors, one with neuronal and the other with non-neuronal features, consistent with the diversity observed in human AT/RTs. To investigate the potential cell(s) of origin of these various AT/RTs, we first explored whether different time points of Smarcb1 inactivation correlated with anatomic location and/or molecular subgroups. We observed that the neuronal group, primarily developing from the subventricular zone and the spinal cord, was almost exclusively obtained with the earliest inactivation time points (E6-E7). In contrast, the non-neuronal group emerged upon Smarcb1 inactivation at any time point (E6-E10) and showed intracranial but extra-parenchymal/meningeal origins. High-resolution analysis of anatomic distribution of 55 human AT/RT and molecular subgroups is in progress. In order to more specifically identify the cell(s) of origin for the neuronal group, we next generated developmental stage-specific conditional knockout mice carrying Smarcb1 inactivation by restricting Cre expression with promoters characteristic for various neural stem cells/progenitors. While Smarcb1Flox/Flox;Atoh1CreERT2 showed ataxia but failed to give rise to any tumor at any embryonal time point, Smarcb1Flox/Flox;Ascl1CreERT2 did not show any phenotype. Targeting Nestin-expressing cells led to tumors with morphologic rhabdoid features; these tumors again showed molecular diversity as observed in human AT/RTs. In conclusion, we show that deletion of Smarcb1 determines mouse AT/RT subtypes depending on spatial and temporal factors. Our new mouse models not only give insight into the cell(s) of origin, but also provide interesting preclinical models of AT/RTs. Citation Format: Zhi-Yan Han, Mamy Andrianteranagna, Maria Jesus-Lobon-Iglesias, Arnault Tauziède-Espariat, Kevin Beccaria, Paul Fréneaux, Joshua J. Waterfall, Julien Masliah-Planchon, Christine Bourneix, Gaelle Pierron, Amaury Leruste, Céline Chauvin, Didier Surdez, Pascale Varlet, Christelle Dufour, Olivier Delattre, Volodia Dangouloff-Ros, Franck Bourdeaut. Spatial and temporal conditions for Smarcb1 deletion determines mouse AT/RT (atypical teratoid/rhabdoid tumor) subtype [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr B68.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,459

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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Résumé présentoui

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