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Enregistrement W3047087784 · doi:10.1101/2020.08.04.237180

An acylsugar-deficient <i>Nicotiana benthamiana</i> strain for aphid and whitefly research

2020· preprint· en· W3047087784 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAdvanced Research Projects AgencyDefense Advanced Research Projects AgencyDeutsche ForschungsgemeinschaftU.S. Department of AgricultureNational Science Foundation
Mots-clésMutantGeneNicotiana benthamianaWhiteflyGene knockdownMutationRNA interferenceWild typeStrain (injury)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nicotiana benthamiana is used extensively as a platform for transient gene expression and as a model system for studying plant-virus interactions. However, many tobacco-feeding generalist herbivores, including Myzus persicae (green peach aphid), Bemisia tabaci (whitefly), Macrosiphum euphorbiae (potato aphid), Heliothis virescens (tobacco budworm), Trichoplusia ni (cabbage looper), and Helicoverpa zea (corn earworm), grow poorly on N. benthamiana , limiting its utility for research on plant-insect interactions. Using CRISPR/Cas9, we generated knockout mutations in two N. benthamiana acylsugar acyltransferases, ASAT1 and ASAT2 , which contribute to the biosynthesis of insect-deterrent acylsucroses. Whereas asat1 mutations reduced the abundance of two predominant acylsucroses, asat2 mutations caused almost complete depletion of foliar acylsucroses. The tested hemipteran and lepidopteran species survived, gained weight, and/or reproduced significantly better on asat2 mutant plants than on wildtype N. benthamiana . Furthermore, both asat1 and asat2 mutations reduced the water content and increased the temperature of leaves, indicating that foliar acylsucroses can protect against desiccation. Two experiments demonstrated the utility of the N. benthamiana asat2 mutant line for insect bioassays. Transmission of turnip mosaic virus by M. persicae was significantly improved by an asat2 mutation. Tobacco rattle virus constructs were used for virus-induced gene silencing of acetylcholinesterase , squalene synthase , toll-like receptor 7 , and tubulin-specific chaperon D genes in B. tabaci , an experiment that would have been difficult with wild-type N. benthamiana due to high insect mortality. Additionally, the absence of acylsugars in asat2 mutant lines will simplify transient expression assays for the functional analysis of acylsugar biosynthesis genes from other Solanaceae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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