Abstract IA27: Patient-derived organoids in pediatric cancer research
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Recent advances in in vitro culture technologies, such as adult stem cell-derived organoids, have opened up new avenues for the development of novel, more physiologic human cancer models. Such preclinical models are essential for efficient translation of basic cancer research into novel treatment regimens. We succeeded in growing organoids from a range of pediatric solid tumors, including Wilms’ tumors, renal cell carcinomas, and different types of rhabdoid tumors (i.e., AT/RT, MRT). Tumor organoids retain many characteristics of parental tumor tissue. For instance, Wilms’ tumor organoids retain the cellular heterogeneity of tumors, as they are composed of an intricate network of different cell types. Moreover, we demonstrate that tumor organoids are amenable to gene editing and high-throughput drug screens. In conclusion, our pediatric cancer organoids capture disease and tissue heterogeneity and provide a platform for basic cancer research, drug screening, and personalized medicine. Citation Format: Camilla Calandrini, Frans Schutgens, Rurika Oka, Thanasis Margaritis, Tito Candelli, Luka Mathijsen, Carola Ammerlaan, Ravian van Ineveld, Sepideh Derakhshan, Lars Custers, Philip Lijnzaad, Harry Begthel, Hinri Kerstens, Maarten Rookmaker, Marianne Verhaar, Patrick Kemmeren, Ronald de Krijger, Kathy Pritchard-Jones, Anne Rios, Marry van den Heuvel-Eibrink, Frank Holstege, Ruben van Boxtel, Hans Clevers, Jarno Drost. Patient-derived organoids in pediatric cancer research [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr IA27.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».