DYNC2H1 hypomorphic or retina-predominant variants cause nonsyndromic retinal degeneration
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Determining the role of DYNC2H1 variants in nonsyndromic inherited retinal disease (IRD). METHODS: Genome and exome sequencing were performed for five unrelated cases of IRD with no identified variant. In vitro assays were developed to validate the variants identified (fibroblast assay, induced pluripotent stem cell [iPSC] derived retinal organoids, and a dynein motility assay). RESULTS: Four novel DYNC2H1 variants (V1, g.103327020_103327021dup; V2, g.103055779A>T; V3, g.103112272C>G; V4, g.103070104A>C) and one previously reported variant (V5, g.103339363T>G) were identified. In proband 1 (V1/V2), V1 was predicted to introduce a premature termination codon (PTC), whereas V2 disrupted the exon 41 splice donor site causing incomplete skipping of exon 41. V1 and V2 impaired dynein-2 motility in vitro and perturbed IFT88 distribution within cilia. V3, homozygous in probands 2-4, is predicted to cause a PTC in a retina-predominant transcript. Analysis of retinal organoids showed that this new transcript expression increased with organoid differentiation. V4, a novel missense variant, was in trans with V5, previously associated with Jeune asphyxiating thoracic dystrophy (JATD). CONCLUSION: The DYNC2H1 variants discussed herein were either hypomorphic or affecting a retina-predominant transcript and caused nonsyndromic IRD. Dynein variants, specifically DYNC2H1 variants are reported as a cause of non syndromic IRD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».