Abstract B36: A novel model of osteosarcomagenesis reveals dysregulation of oxidative phosphorylation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The purpose of this study is to develop a new model to study osteosarcoma in order to elucidate cellular pathways important in osteosarcomagenesis that are potential therapeutic targets. Osteosarcoma is the most common bone malignancy in childhood and early adolescence. Thirty percent of patients with the rare genetic disorder Type II Rothmund-Thomson syndrome (RTS) develop osteosarcoma. Patients with RTS have biallelic mutations in the RECQL4 gene, which encodes an ATP-dependent DNA helicase. Unfortunately, many attempts to model RTS-associated osteosarcoma have not been successful. Here, we describe a patient-derived induced pluripotent stem cell (iPSC) model capable of recapitulating the process of osteosarcomagenesis. Briefly, RTS patient fibroblasts are reprogrammed to iPSCs, then subsequently differentiated to mesenchymal stem cells. These cells are validated and further differentiated to early and late osteoblasts, the potential precursors of osteosarcoma. Because the iPSC-derived osteoblasts retain the genetic fidelity of the patient from which they were derived, we believe these cells are the ideal model to study the molecular mechanism associated with RTS-associated osteosarcoma. Utilizing the patient-derived osteoblasts, we have performed RNAseq and subsequent GSEA analyses to explore the transcriptome of RTS osteoblasts and found the dysregulation of oxidative phosphorylation in RTS osteoblasts. Interestingly, it has been reported that specific vacuolar ATPases are upregulated in patient cells. It has been reported that vacuolar ATPases function to increase proton concentration within the mitochondria and also within the extracellular environment. Understanding key mechanisms of osteosarcomagenesis is critical to making steps toward novel therapeutics. Citation Format: Brittany E. Jewell, An Xu, Ruoji Zhou, Dandan Zhu, Linchao Lu, Ruying Zhao, Lisa L. Wang, Dung-Fang Lee. A novel model of osteosarcomagenesis reveals dysregulation of oxidative phosphorylation [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr B36.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».