Root membrane lipids as potential biomarkers to discriminate silage‐corn genotypes cultivated on podzolic soils in boreal climate
Notice bibliographique
Résumé
Root membrane lipids are important biomolecules determining plant's ability to adapt to different growing environmental or climatic conditions. Herein, we demonstrate the potential use of root membrane lipids as biomarkers to discriminate silage-corn genotypes based on herbicide and insect/pest resistance genetic traits when cultivated on podzolic soils under short growing and moderately warm summer season in boreal climate. Lipids in root membranes of field grown silage-corn genotypes were previously quantified at crop maturity by ultra-high-performance liquid chromatography-hydrophilic interaction chromatography-heated electrospray ionization mass spectrometry. The lipid identified and quantified in silage-corn roots were phospholipids, glycolipids and sphingolipids. Following hierarchical cluster analysis, three groups of membrane lipids were observed to be very effective in segregating the five silage-corn genotypes. The first group consisted of hexosylceramide (HexCer), phosphatidylcholine (PC) and phosphatidylinositol (PI). The second group consisted of lysophosphatidic acid (LPA16:0) and lysophosphatidylcholine (LPC16:0), while the third group consisted of 37 molecular species from observed lipids (phospholipids, glycolipids, sphingolipids). Partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA) based on 37 membrane lipid species, as well as principal component analysis using the variables important in projection derived from the PLS-DA segregated the five silage-corn genotypes into three groups according to their pesticide/herbicide resistant traits. This study is second to none using root lipidomics in discriminating different silage-corn genotypes based on their herbicide and insect/pest resistance genetic traits for cultivation in boreal climates. The segregated genotypes possess three different genetic traits for herbicide and insect/pest resistance including VT Double Pro (VT2P), VT Triple Pro Roundup Ready (VT3P/RR) and Roundup Ready-2 corn (RR2). These findings demonstrate that root membrane lipids could serve as appropriate chemical biosignatures to identify silage-corn genotypes based on herbicide and insect/pest resistance genetic traits suitable for cultivation in boreal climates.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».