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Enregistrement W3047518314 · doi:10.1158/1538-7445.pedca19-b48

Abstract B48: A LIN28B-PDZ kinase axis promotes neuroblastoma metastasis

2020· article· en· W3047518314 sur OpenAlexaboutno aff
Dongdong Chen, Julie Cox, Jayabhargav Annam, Melanie Weingart, Grace Essien, Komal S. Rathi, Priya Khurana, Selma M. Cuya, Jo Lynne Harenza, Kristopher R. Bosse, Adeiye A. Pilgrim, John M. Maris, Robert W. Schnepp

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroblastomaMetastasisCancer researchSmall hairpin RNAGene knockdownBiologymicroRNACancerKinaseDownregulation and upregulationApoptosisCell biologyCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Neuroblastoma, an aggressive cancer of the developing sympathetic nervous system, continues to cause significant morbidity and mortality, highlighting the need to identify novel therapeutic vulnerabilities. We previously demonstrated that the RNA binding protein (RBP) LIN28B is an oncogenic driver and induces neuroblastoma proliferation, in part by regulating a RAN GTPase-Aurora kinase A axis. LIN28B blocks the processing of the let-7 family of tumor suppressors and binds mRNAs directly. In addition to alterations in cell cycle/apoptosis, metastatic dissemination is a hallmark of cancer that is incompletely understood, and neuroblastoma exhibits a striking proclivity for widespread metastases. In these studies, we investigated how LIN28B shapes neuroblastoma metastasis. Methods: We generated GFP-luciferase expressing neuroblastoma cell line models in which LIN28B levels were manipulated, injected these models into the tail veins of NSG mice, and tracked dissemination using an IVIS Spectrum system. We used gain- and loss-of-function approaches (siRNAs, shRNAs, microRNA mimetics) to manipulate transcripts of interest in neuroblastoma cells and measured effects on self-renewal, invasion, and downstream signaling. To discover LIN28B-associated pathways, we assessed clinically annotated mRNA expression datasets. Results: Mice injected with LIN28B-depleted neuroblastoma cells exhibit a delayed onset of tumor metastasis, reduced tumor burden, and extended survival (103 days vs. 50 days, p<0.0001), compared to mice bearing neuroblastoma cells expressing control scrambled shRNA. We next demonstrated that LIN28B promotes, and let-7 opposes, self-renewal and migration, two hallmarks of metastasis. As we discovered that Aurora kinase A is a novel LIN28B target, we speculated that LIN28B might positively regulate diverse oncogenic kinases to promote metastasis. We evaluated the TARGET dataset of neuroblastoma tumors and found LIN28B mRNA expression to be robustly correlated with PDZ-binding kinase mRNA expression (PBK; r=0.67; p=3.2 × 10-33), a kinase with roles in cell proliferation/survival, self-renewal, and metastasis, and is overexpressed in multiple malignancies. We demonstrated that LIN28B directly promotes, and let-7 opposes, the expression of PBK protein, and, indeed, that PBK is a novel and direct let-7 target. Moreover, we reveal that MYCN binds to the promoter of PBK and positively regulates PBK RNA and protein expression. Finally, PBK depletion mimics the effects of LIN28B depletion, with respect to self-renewal and invasion. Conclusions: Taken together, our findings suggest that LIN28B/let-7 shapes neuroblastoma metastasis, in part through influencing PBK, a kinase not previously implicated in the pathogenesis of aggressive pediatric solid tumors. Current studies are defining whether PBK, a therapeutically tractable target for which clinically relevant inhibitors exist, represents a novel therapeutic vulnerability in metastatic neuroblastoma. Citation Format: Dongdong Chen, Julie Cox, Jayabhargav Annam, Melanie Weingart, Grace Essien, Komal Rathi, Priya Khurana, Selma Cuya, Jo Lynne Harenza, Kristopher Bosse, Adeiye Pilgrim, John M. Maris, Robert W. Schnepp. A LIN28B-PDZ kinase axis promotes neuroblastoma metastasis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr B48.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,159
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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