Abstract A18: Characterization of checkpoint inhibitors in the tumor microenvironment (TME) and peripheral blood in endemic Burkitt Lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: The tumor microenvironment and the interaction between immune checkpoint inhibitors (ICIs) and tumor cells are essential to understand for designing future immunotherapy strategies. In this study, we aim to characterize the tumor microenvironment (TME) in children diagnosed with endemic Burkitt lymphoma (eBL), the most common pediatric cancer in Africa. A history of chronic malaria (Plasmodium falciparum) and Epstein-Barr virus (EBV) coinfections are both risk factors in the etiology of eBL. Methods: Using multicolor flow cytometry and single-cell RNA sequencing, we analyzed the expression of immune checkpoint inhibitors in T cells from the tumor microenvironment and from peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of eBL patients, along with age-matched controls with different malaria exposure. Additionally, CD8 T-cell infiltration was confirmed by immunohistochemistry. Results: PD-1+ CD4 T cells from eBL PBMCs were increased in number compared to healthy controls from the malaria-endemic area (p=0.03). Both CD4 and CD8 T cells from eBL PBMCs reveal higher frequency of TIGIT expressers compared to healthy controls (non-malaria endemic) (p=0.002, p=0.007 respectively). PD1+ TIGIT+ IFNG- memory CD4 T cells phenotype from eBL PBMCs was increased upon short stimulation with PMA/ionomycin, as well as “naive-like” CD95+ PD1high TIGIT+ CTLA4+ IFNG+ CD8T cells. Tumor samples from 4 eBL patient were used on single-cell analysis; we observed activated T-cells profile that highly upregulated TIGIT within the tumor microenvironment. We also noticed relatively low expression of other ICIs such as PD1, TIM3, LAG3, and CTLA4. Base on all these data, we calculated an exhaustion score that was higher than the cytotoxicity score in our eBL-derived tumor-infiltrating lymphocytes (TILs). In addition, we use immunohistochemistry staining to confirm CD8 T-cell infiltration and ICI expression in eBL tumor fine needle aspirates. Our future directions will employ TIGIT blockade inhibitor studies of CD8 T cells, in order to increase expansion and function of CD8 TILs. Our results will help support future development of ICI therapies in endemic Burkitt lymphoma. Citation Format: Priya Saikumar-Lakshmi, Cliff Oduor, Catherine Forconi, Patrick Marsh, John Michael Ong’echa, Jeffrey Bailey, Ann Moormann. Characterization of checkpoint inhibitors in the tumor microenvironment (TME) and peripheral blood in endemic Burkitt Lymphoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr A18.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».