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Enregistrement W3047531668 · doi:10.1016/j.stemcr.2020.07.012

A Semi-automated and Scalable 3D Spheroid Assay to Study Neuroblast Migration

2020· article· en· W3047531668 sur OpenAlexfundno aff
Martin Ducker, Valerie Millar, Daniel Ebner, Francis G. Szele

Notice bibliographique

RevueStem Cell Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEshelman Institute for Innovation, University of North Carolina at Chapel HillJanssen PharmaceuticalsLineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel HillTakeda Pharmaceuticals U.S.A.Merck Sharp and DohmeNational Institutes of HealthMeso Scale DiagnosticsNational Center for Advancing Translational SciencesJanssen BiotechInnovative Medicines InitiativeAbbVieNovartis PharmaCanada Foundation for InnovationOntario Ministry of Economic Development and InnovationWellcome TrustGenome CanadaBayerNational Cancer InstituteTakeda Pharmaceutical CompanyUniversity of North CarolinaPfizer UKMerck KGaAPfizerNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBoehringer Ingelheim
Mots-clésNeuroblastNeuroregenerationBiologySubventricular zoneGene knockdownCell biologyCell migrationNeuroscienceNeurogenesisNeuroprotectionNeural stem cellCell cultureStem cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The subventricular zone of the mammalian brain is the major source of adult born neurons. These neuroblasts normally migrate long distances to the olfactory bulbs but can be re-routed to locations of injury and promote neuroregeneration. Mechanistic understanding and pharmacological targets regulating neuroblast migration is sparse. Furthermore, lack of migration assays limits development of pharmaceutical interventions targeting neuroblast recruitment. We therefore developed a physiologically relevant 3D neuroblast spheroid migration assay that permits the investigation of large numbers of interventions. To verify the assay, 1,012 kinase inhibitors were screened for their effects on migration. Several induced significant increases or decreases in migration. MuSK and PIK3CB were selected as putative targets and their knockdown validated increased neuroblast migration. Thus, compounds identified through this assay system could be explored for their potential in augmenting neuroblast recruitment to sites of injury for neuroregeneration, or for decreasing malignant invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,943

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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