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Enregistrement W3047584058 · doi:10.1158/1538-7445.pedca19-a33

Abstract A33: HIF2 in pediatric high-grade glioma and its targeting

2020· article· en· W3047584058 sur OpenAlexaboutno aff
Quentin Fuchs, Anne Florence Blandin, Isabelle Lelong Rebel, Marina Pierrevelcin, Monique Dontenwill, Natacha Entz‐Werlé

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsBiomarkerCancer researchBiologyHistonePediatric cancerMedicineBioinformaticsCancerOncologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pediatric high-grade gliomas (pHGGs) represent a very dismal disease that is needing new innovative compound for treatment. Despite the past discovery of histone H3 driver mutations, we are not able for instance to stop this induced process on epigenetic remodulation. Therefore, there is since a decade proactive works aimed to discover new targetable proteins in these tumors. In our recent previous works in pHGGs, we highlighted HIF2alpha as a biomarker of worse prognosis and outcome and a key in treatment resistance. Therefore, this new project was designed to determine in several patient-derived cell lines (5 PDCLs) the presence of HIF2alpha, its role and its induction in normoxic and hypoxic microenvironment concomitantly by immunofluorescence and Western blot assessments and RNA sequencing analyses. Complementary ChipSeq was also performed using HIF2 antibodies to determine its role as a transmission factor. Specific promoters were involved. After the confirmation of its frequent presence in multiple PDCLs initiated from thalamic pHGGs and DIPG, we used allosteric inhibitors to target HIF2alpha. Surprisingly, this protein was expressed constantly in hypoxic and normoxic conditions and specifically in PDCLs bearing stem cell features. Specific expression associations were established between stemness markers and HIF2alpha. To go further, we tested specific HIF2A inhibitors, which were having an impact on cell proliferation and on the decrease of the target itself. In conclusion, HIF2 seem to be a major biomarker in pHGGs that might be targeted, and it is a useful new opportunity for pHGGs treatments. Citation Format: Quentin Fuchs, Anne Florence Blandin, Isabelle Lelong Rebel, Marina Pierrevelcin, Monique Dontenwill, Natacha Entz-Werlé. HIF2 in pediatric high-grade glioma and its targeting [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr A33.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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