Permutation-based inference for spatially localized signals in longitudinal MRI data
Notice bibliographique
Résumé
Alzheimer's disease is a neurodegenerative disease in which the degree of cortical atrophy in specific structures of the brain serves as a useful imaging biomarker. Recent approaches using linear mixed effects (LME) models in longitudinal neuroimaging have been powerful and flexible in investigating the temporal trajectories of cortical thickness. However, massive-univariate analysis, a simplified approach that obtains a summary statistic (e.g., a p-value) for every vertex along the cortex, is insufficient to model cortical atrophy because it does not account for spatial similarities of the signals in neighboring locations. In this article, we develop a permutation-based inference procedure to detect spatial clusters of vertices showing statistically significant differences in the rates of cortical atrophy. The proposed method, called SpLoc, uses spatial information to combine the signals adaptively across neighboring vertices, yielding high statistical power while controlling family-wise error rate (FWER) accurately. When we reject the global null hypothesis, we use a cluster selection algorithm to detect the spatial clusters of significant vertices. We validate our method using simulation studies and apply it to the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) data to show its superior performance over existing methods. An R package for implementing SpLoc is publicly available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,026 | 0,106 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».