Abstract B42: Mutant RAS represses CASZ1, a novel regulator of MYOD and MYOG, to inhibit embryonal rhabdomyosarcoma differentiation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Embryonal rhabdomyosarcoma (ERMS) is a childhood cancer that expresses myogenic master regulatory factor MYOD but fails to differentiate. Zinc finger transcription factor CASZ1 is a tumor suppressor and orchestrates cell-fate specification, commitment, and differentiation in many cell types during development. CASZ1 is expressed during skeletal myogenesis; however, whether CASZ1 plays a role in skeletal muscle cell differentiation and RMS pathogenesis is unknown. Here we uncover that CASZ1 crosstalks with myogenic regulatory factors Myf5, MyoD, and Myog to regulate myogenesis in C2C12 cells. Public transcriptome data show that CASZ1 mRNA levels are lower in ERMS compared to normal muscle (p<0.001). CASZ1 levels decrease upon oncogenic activation of RAS-MEK pathway and increase when ERMS undergoes terminal differentiation after MEK inhibitor trametinib (MEKi) treatment. Analysis of super-enhancer landscape in MEKi-induced differentiated ERMS cells reveals a core transcriptional regulatory circuitry (CRC) including CASZ1, MYOD, and MYOG. Loss of CASZ1 attenuates MEKi-induced myogenic programming in ERMS. Restoration of CASZ1 in ERMS cells induces muscle differentiation. ChIP-seq, ATAC-seq, and RNA-seq results show that CASZ1 directly upregulates expression of skeletal muscle differentiation genes and represses non-muscle genes through affecting chromatin accessibility, enhancer maintenance, and super-enhancer activity. Next-generation sequencing of primary RMS tumors identified a nonsynonymous single-nucleotide variant causing an arginine-to-cysteine switch (R25C). When evaluated in 293T and ERMS cells, R25C impairs CASZ1 nuclear localization and fails to activate target genes’ transcription. Tumor xenograft studies show that CASZ1 suppresses RMS tumor growth (p<0.005), while the CASZ1-R25C mutant has no effect. Taken together, loss of CASZ1 activity, due to RAS-MEK signaling or genetic alteration, impairs ERMS differentiation, contributing to RMS tumorigenesis. Citation Format: Zhihui Liu, Xiyuan Zhang, Haiyan Lei, Norris Lam, Oliver Yockey, Max Xu, Arnulfo Mendoza, Jun S Wei, Javed Khan, Marielle E. Yohe, Jack F. Shern, Carol J. Thiele. Mutant RAS represses CASZ1, a novel regulator of MYOD and MYOG, to inhibit embryonal rhabdomyosarcoma differentiation [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr B42.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».