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Enregistrement W3048214116 · doi:10.1016/j.bbmt.2020.08.003

A Personalized Prediction Model for Outcomes after Allogeneic Hematopoietic Cell Transplant in Patients with Myelodysplastic Syndromes

2020· article· en· W3048214116 sur OpenAlexaff
Aziz Nazha, Zhen‐Huan Hu, Tao Wang, R. Coleman Lindsley, Hisham Abdel‐Azim, Mahmoud Aljurf, Ulrike Bacher, Asad Bashey, Jean‐Yves Cahn, Jan Černý, Edward A. Copelan, Zachariah DeFilipp, Miguel Ángel Díaz, Nosha Farhadfar, Shahinaz M. Gadalla, Robert Peter Gale, Biju George, Usama Gergis, Michael R. Grunwald, Betty K. Hamilton, Shahrukh K. Hashmi, Gerhard Hildebrandt, Yoshihiro Inamoto, Matt Kalaycio, Rammurti T. Kamble, Mohamed A. Kharfan‐Dabaja, Hillard M. Lazarus, Jane L. Liesveld, Mark R. Litzow, Navneet S. Majhail, Hemant S. Murthy, Sunita Nathan, Taiga Nishihori, Attaphol Pawarode, David A. Rizzieri, Mitchell Sabloff, Bipin N. Savani, Levanto Schachter, Harry C. Schouten, Sachiko Seo, Nirav N. Shah, Melhem Solh, David Valcárcel, Ravi Vij, Erica D. Warlick, Baldeep Wirk, William A. Wood, Jean A. Yared, Edwin P. Alyea, Uday Popat, Ronald Sobecks, Bart L. Scott, Ryotaro Nakamura, Wael Saber

Notice bibliographique

RevueBiology of Blood and Marrow Transplantation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteOffice of Naval ResearchNational Heart, Lung, and Blood InstituteHealth Resources and Services Administration
Mots-clésMedicineMyelodysplastic syndromesInternational Prognostic Scoring SystemOncologyInternal medicineCohortConcordanceTransplantationHematopoietic stem cell transplantationMyeloidNPM1Bone marrowGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (HCT) remains the only potentially curative option for myelodysplastic syndromes (MDS). Mortality after HCT is high, with deaths related to relapse or transplant-related complications. Thus, identifying patients who may or may not benefit from HCT is clinically important. We identified 1514 patients with MDS enrolled in the Center for International Blood and Marrow Transplant Research Registry and had their peripheral blood samples sequenced for the presence of 129 commonly mutated genes in myeloid malignancies. A random survival forest algorithm was used to build the model, and the accuracy of the proposed model was assessed by concordance index. The median age of the entire cohort was 59 years. The most commonly mutated genes were ASXL1(20%), TP53 (19%), DNMT3A (15%), and TET2 (12%). The algorithm identified the following variables prior to HCT that impacted overall survival: age, TP53 mutations, absolute neutrophils count, cytogenetics per International Prognostic Scoring System-Revised, Karnofsky performance status, conditioning regimen, donor age, WBC count, hemoglobin, diagnosis of therapy-related MDS, peripheral blast percentage, mutations in RAS pathway, JAK2 mutation, number of mutations/sample, ZRSR2, and CUX1 mutations. Different variables impacted the risk of relapse post-transplant. The new model can provide survival probability at different time points that are specific (personalized) for a given patient based on the clinical and mutational variables that are listed above. The outcomes' probability at different time points may aid physicians and patients in their decision regarding HCT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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