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Enregistrement W3048339216 · doi:10.3389/fninf.2020.00033

A Quantitative EEG Toolbox for the MNI Neuroinformatics Ecosystem: Normative SPM of EEG Source Spectra

2020· article· en· W3048339216 sur OpenAlexaffabout
Jorge Bosch‐Bayard, Eduardo Aubert-Vázquez, Shawn T. Brown, Christine Rogers, Gregory Kiar, Tristan Glatard, Lalet Scaria, Lídice Galán‐Garcia, María L. Bringas-Vega, Trinidad Virues‐Alba, Armin Taheri, Samir Das, Cécile Madjar, Zia Mohaddes, Leigh MacIntyre, Alan C. Evans, Pedro A. Valdés‐Sosa

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroinformatics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroinformaticsToolboxComputer scienceElectroencephalographyStatistical parametric mappingNormativeParametric statisticsArtificial intelligenceData scienceStatisticsPsychologyNeuroscienceMedicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Tomographic Quantitative Electroencephalography (qEEGt) toolbox is integrated with the Montreal Neurological Institute (MNI) Neuroinformatics Ecosystem as a docker into the Canadian Brain Imaging Research Platform (CBRAIN). qEEGt produces age-corrected normative Statistical Parametric Maps of EEG log source spectra testing compliance to a normative database. This toolbox was developed at the Cuban Neuroscience Center as part of the first wave of the Cuban Human Brain Mapping Project (CHBMP) and has been validated and used in different health systems for several decades. Incorporation into the MNI ecosystem now provides CBRAIN registered users access to its full functionality and is accompanied by a public release of the source code on GitHub and Zenodo repositories. Among other features are the calculation of EEG scalp spectra, and the estimation of their source spectra using the Variable Resolution Electrical Tomography (VARETA) source imaging. Crucially, this is completed by the evaluation of z spectra by means of the built-in age regression equations obtained from the CHBMP database (ages 5-87) to provide normative Statistical Parametric Mapping of EEG log source spectra. Different scalp and source visualization tools are also provided for evaluation of individual subjects prior to further post-processing. Openly releasing this software in the CBRAIN platform will facilitate the use of standardized qEEGt methods in different research and clinical settings. An updated precis of the methods is provided in Appendix I as a reference for the toolbox. qEEGt/CBRAIN is the first installment of instruments developed by the neuroinformatic platform of the Cuba-Canada-China (CCC) project.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1300,062

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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