Occurrence and characterization of <i>Ustilago cynodontis</i> (Passerini) Henn., the causal agent of Bermudagrass (<i>Cynodon dactylon</i>) smut in Egypt
Notice bibliographique
Résumé
Smutted Bermudagrass (Cynodon dactylon L.) plants with diseased spikelets and completely deformed inflorescences covered with black teliospores were collected from five locations at the borders of plantations in Kafr El-Sheikh province, Egypt, in April 2018. The fungus was isolated from infected plants and identified as Ustilago cynodontis (Passerini) Henn. based on its cultural and morphological characteristics, molecular techniques, and pathogenicity tests. Slender colonies of U. cynodontis with irregular edges were observed on potato dextrose agar (PDA) after 6 days at 28°C. The mature teliospores were examined by scanning electron microscopy. Crystal-like structures with a pyramidal shape were observed to be produced by the fungus in culture. The crystals were further examined using an energy dispersive spectroscopy system connected to the scanning electron microscope and their dimensions were measured (18 ± 2 µm × 16 ± 2 µm × 19 ± 2 µm). PCR analysis with internal transcribed spacer (ITS) specific primers yielded an amplicon that shared a 99% identity with U. cynodontis sequences in GenBank. Phylogenetic analysis indicated that the Egyptian isolate of U. cynodontis shared the greatest similarity with isolates of U. cynodontis from Ethiopia, Iran, India, United States, Mexico, Spain, and China. Inoculation of Bermudagrass with the isolated fungus resulted in symptoms of smut similar to those observed in the field. To our knowledge, this is the first report concerning the occurrence and characterization of U. cynodontis, the causal agent of Bermudagrass smut, in Egypt.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».