Generation and Characterization of a Virulent Leptosphaeria maculans Isolate Carrying a Mutated AvrLm7 Gene Using the CRISPR/Cas9 System
Notice bibliographique
Résumé
Blackleg, caused by the fungal pathogen Leptosphaeria maculans, is the most important disease affecting canola (Brassica napus) crops worldwide. We employed the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/CRISPR-associated (Cas) system to generate the mutant isolate umavr7 from a point mutation of the AvrLm7 coding region in a L. maculans isolate (UMAvr7). Reverse transcription PCR and unpublished transcriptome data confirmed that the AvrLm7 gene was knocked out in the mutant isolate. Pathogenicity tests indicated that umavr7 can cause large lesions on a set of B. napus differential lines that express different resistance (R) genes. Comparative pathogenicity tests between UMAvr7 (wild type) and umavr7 on the corresponding B. napus cultivar 01-23-2-1 (with Rlm7) showed that umavr7 is a mutant isolate, producing large grey/green lesions on cotyledons. The pathogenicity of the mutant isolate was shifted from avirulent to virulent on the B. napus Rlm7 line. Therefore, this mutant is virulence on the identified resistant genes to blackleg disease in B. napus varieties/lines. Superoxide accumulated differently in cotyledons in response to infection with UMAvr7 and umavr7, especially in resistant cultivar 01-23-2-1. Resistance/susceptibility was further evaluated on 123 B. napus genotypes with the mutant isolate, umavr7. Only 6 of the 123 genotypes showed resistance to umavr7. The identification of these six resistant B. napus genotypes will lead to further studies on the development of blackleg disease resistance through breeding and the identification of novel R genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».