MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3048435885 · doi:10.5858/arpa.2020-0176-oa

Morphologic Features of Fibrotic Hypersensitivity Pneumonitis in Transbronchial Cryobiopsies Versus Video-Assisted Thoracoscopic Biopsies: An In Silico Study

2020· article· en· W3048435885 sur OpenAlexaff
Andrew Churg

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypersensitivity pneumonitisMedicinePathologyVideo-assisted thoracoscopic surgeryRadiologyLungSurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT.—: There is interest in using transbronchial cryobiopsies (CBs) for the diagnosis of fibrotic (chronic) hypersensitivity pneumonitis (FHP), but with little information in the literature about what features are diagnostic in CBs. OBJECTIVE.—: To determine, using in silico investigation, whether features supporting a diagnosis of FHP in video-assisted thoracoscopic (VATS) biopsies can be identified in CBs. DESIGN.—: In silico circular "cryobiopsies," 5.25 mm in diameter (21.6 mm2), were created on the slides of 15 VATS biopsy cases that had been assigned a 60% or greater confident diagnosis of FHP at a specially devised multidisciplinary discussion. Using stratified random sampling, up to 8 "cryobiopsies" per case were analyzed for the presence of giant cells/granulomas or peribronchiolar metaplasia affecting 50% or more of the bronchioles, features that had statistically supported a diagnosis of FHP on the VATS biopsies in the multidisciplinary discussion exercise. RESULTS.—: Giant cells/granulomas were detected with very low sensitivities in the "cryobiopsies." Using peribronchiolar metaplasia in 50% or more of bronchioles alone, the sensitivity/specificity for a diagnosis of FHP of 2 "cryobiopsies" compared to the corresponding VATS biopsy was 0.57/0.63; for 4 "cryobiopsies," 0.86/0.75; and for 8 "cryobiopsies," 0.83/0.71. Adding giant cells/granulomas slightly improved these numbers to 0.63/0.71 for 2 "cryobiopsies"; 1.00/0.86 for 4; and 1.00/0.80 for 8. CONCLUSIONS.—: In the setting of a multidisciplinary discussion where FHP is part of the differential diagnostic choices, 4 actual CBs with an area of roughly 20 mm2 each should have good sensitivity and reasonable specificity for diagnosing FHP using these specific morphologic criteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArchives of Pathology & Laboratory MedicineMême sujetInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary FibrosisTravaux en français237 207