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Enregistrement W3048822610 · doi:10.1017/s0956792520000261

Localised signalling compartments in 2D coupled by a bulk diffusion field: Quorum sensing and synchronous oscillations in the well-mixed limit

2020· article· en· W3048822610 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Applied Mathematics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNonlinear Dynamics and Pattern Formation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOdeCoupling (piping)Ordinary differential equationDiffusionPhysicsBifurcationRADIUSThermal diffusivityNonlinear systemLimit (mathematics)Mathematical analysisDifferential equationMaterials scienceMathematicsComputer scienceThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analyse oscillatory instabilities for a coupled partial-ordinary differential equation (PDE-ODE) system modelling the communication between localised spatially segregated dynamically active signalling compartments that are coupled through a passive extracellular bulk diffusion field in a bounded 2D domain. Each signalling compartment is assumed to secrete a chemical into the extracellular medium (bulk region), and it can also sense the concentration of this chemical in the region around its boundary. This feedback from the bulk region, resulting from the entire collection of cells, in turn modifies the intracellular dynamics within each cell. In the limit where the signalling compartments are circular discs with a small common radius ɛ ≪ 1 and where the bulk diffusivity is asymptotically large, a matched asymptotic analysis is used to reduce the dimensionless PDE–ODE system into a nonlinear ODE system with global coupling. For Sel’kov reaction kinetics, this ODE system for the intracellular dynamics and the spatial average of the bulk diffusion field are then used to investigate oscillatory instabilities in the dynamics of the cells that are triggered due to the global coupling. In particular, numerical bifurcation software on the ODEs is used to study the overall effect of coupling defective cells (cells that behave differently from the remaining cells) to a group of identical cells. Moreover, when the number of cells is large, the Kuramoto order parameter is computed to predict the degree of phase synchronisation of the intracellular dynamics. Quorum sensing behaviour, characterised by the onset of collective behaviour in the intracellular dynamics as the number of cells increases above a threshold, is also studied. Our analysis shows that the cell population density plays a dual role of triggering and then quenching synchronous oscillations in the intracellular dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,755
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle