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Enregistrement W3048824820 · doi:10.3389/fdata.2020.00024

Statistical Disease Progression Modeling in Alzheimer Disease

2020· article· en· W3048824820 sur OpenAlexfundno aff
Lars Lau Rakêt

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Big Data · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaBiogenU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésCognitionDiseaseCognitive declineAlzheimer's diseaseCognitive testPsychologyEffects of sleep deprivation on cognitive performanceMedicineDementiaPsychiatryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background:The characterizing symptom of Alzheimer disease (AD) is cognitive deterioration. While much recent work has focused on defining AD as a biological construct, most patients are still diagnosed, staged, and treated based on their cognitive symptoms. But the cognitive capability of a patient at any time throughout this deterioration does not only reflect the disease state, but also the effect of the cognitive decline on the patient’s predisease cognitive capability. Patients with high predisease cognitive capabilities tend to score better on cognitive tests that are sensitive early in disease relative to patients with low predisease cognitive capabilities at a similar disease stage. Thus, a single assessment with a cognitive test is often not adequate for determining the stage of an AD patient. Repeated evaluation of patients’ cognition over time may improve the ability to stage AD patients and such longitudinal assessments in combinations with biomarker assessments can help elucidate the time dynamics of biomarkers. In turn, this can potentially lead to identification of markers that are predictive of disease stage and future cognitive decline, possibly before any cognitive deficit is measurable. Methods and Findings:This paper presents a class of statistical disease progression models and applies them to longitudinal cognitive scores. These nonlinear mixed-effects disease progression models explicitly model disease stage, baseline cognition, and the patients’ individual changes in cognitive ability as latent variables. Maximum-likelihood estimation in these models induces a data-driven criterion for separating disease progression and baseline cognition. Applied to data from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative, the model estimated a timeline of cognitive decline that spans approximately 15 years from the earliest subjective cognitive deficits to severe AD dementia. Subsequent analyses demonstrated how direct modeling of latent factors that modify the observed data patterns provides a scaffold for understanding disease progression, biomarkers and treatment effects along the continuous time progression of disease. Conclusions:The presented framework enables direct interpretations of factors that modify cognitive decline. The results give new insights to the value of biomarkers for staging patients and suggest alternative explanations for previous findings related to accelerated cognitive decline among highly educated patients and patients on symptomatic treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,026
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,083

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,026
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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