Mendelian randomisation approaches to the study of prenatal exposures: A systematic review
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Mendelian randomisation (MR) designs apply instrumental variable techniques using genetic variants to study causal effects. MR is increasingly used to evaluate the role of maternal exposures during pregnancy on offspring health. OBJECTIVES: We review the application of MR to prenatal exposures and describe reporting of methodologic challenges in this area. DATA SOURCES: We searched PubMed, EMBASE, Medline Ovid, Cochrane Central, Web of Science, and Google Scholar. STUDY SELECTION AND DATA EXTRACTION: Eligible studies met the following criteria: (a) a maternal pregnancy exposure; (b) an outcome assessed in offspring of the pregnancy; and (c) a genetic variant or score proposed as an instrument or proxy for an exposure. SYNTHESIS: We quantified the frequency of reporting of MR conditions stated, techniques used to examine assumption plausibility, and reported limitations. RESULTS: Forty-three eligible studies were identified. When discussing challenges or limitations, the most common issues described were known potential biases in the broader MR literature, including population stratification (n = 29), weak instrument bias (n = 18), and certain types of pleiotropy (n = 30). Of 22 studies presenting point estimates for the effect of exposure, four defined their causal estimand. Twenty-four studies discussed issues unique to prenatal MR, including selection on pregnancy (n = 1) and pleiotropy via postnatal exposure (n = 10) or offspring genotype (n = 20). CONCLUSIONS: Prenatal MR studies frequently discuss issues that affect all MR studies, but rarely discuss problems specific to the prenatal context, including selection on pregnancy and effects of postnatal exposure. Future prenatal MR studies should report and attempt to falsify their assumptions, with particular attention to issues specific to prenatal MR. Further research is needed to evaluate the impacts of biases unique to prenatal MR in practice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,139 | 0,457 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,015 | 0,013 |
| Bibliométrie | 0,016 | 0,016 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,005 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,006 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».