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Enregistrement W3049210980 · doi:10.1016/j.scr.2020.101955

Generation and characterization of iPSC lines (BGUi004-A, BGUi005-A) from two identical twins with polyalanine expansion in the paired-like homeobox 2B (PHOX2B) gene

2020· article· en· W3049210980 sur OpenAlexfundno aff
Daniel Falik, Tatiana Rabinski, Dor Zlotnik, Reut Eshel, Meshi Zorsky, Tali Garin-Shkolnik, Rivka Ofir, Avital Adato, Avraham Ashkenazi, Gad D. Vatine

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience of respiration and sleep
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAzrieli FoundationIsrael Science Foundation
Mots-clésCongenital central hypoventilation syndromeHomeoboxBiologyInduced pluripotent stem cellExonHomeobox A1MutationGeneticsGerm layerGeneKaryotypeLoss of heterozygosityHypoventilationEmbryonic stem cellChromosomeAnatomyRespiratory systemTranscription factorAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital central hypoventilation syndrome (CCHS) is a rare life-threatening condition affecting the autonomic nervous system that usually presents shortly after birth as hypoventilation or central apnea during sleep. In the majority of cases, heterozygous polyalanine expansion mutations within the third exon of the paired-like homeobox 2B (PHOX2B) gene underlie CCHS. Here, we report the generation of two induced pluripotent stem cell (iPSC) lines from two identical twins with a heterozygous PHOX2B expansion mutation (+5 alanine residues). Both generated lines highly express pluripotency markers, can differentiate into the three germ layers, retain the disease-causing mutation and display normal karyotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,168
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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