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Enregistrement W3049396862 · doi:10.1101/2020.08.12.20171801

Clinical phenotypes and prognostic features of ETMRs (Embryonal Tumor with Multi-layered Rosettes) a new CNS tumor entity: A Rare Brain Tumor Registry study

2020· preprint· en· W3049396862 sur OpenAlexaffabout
Sara Khan, Palma Solano‐Páez, Tannu Suwal, Mei Lu, Salma Al‐Karmi, Ben Ho, CV AlmeidaGonzalez, Derek Stephens, Andrew Dodgshun, Mary Shago, Paula Marrano, Adriana Fonseca, Lindsey M. Hoffman, Sarah Leary, Holly Lindsay, Álvaro Lassaletta, Anne Bendel, Christopher L. Moertel, Andres Morales, Vicente Santa‐María, Cinzia Lavarino, Eloy Rivas, Sebastian Perreault, Benjamin Ellezam, Nada Jabado, Angélica Oviedo, Michal Yalon-Oren, Laura Amariglio, Helen Toledano, James Loukides, Timothy Van Meter, Hideo Nakamura, Tai‐Tong Wong, Kuo-Sheng Wu, Chien-Jui Cheng, Young‐Shin Ra, Milena La Spina, Luca Massimi, Anna Maria Buccoliero, Alyssa Reddy, Rong Li, G. Yancey Gillespie, Dariusz Adamek, Jason Fangusaro, David Scharnhorst, Joseph C. Torkildson, Donna L. Johnston, Jean Michaud, Lucie Lafay‐Cousin, Jennifer A. Chan, Frank K.H. van Landeghem, Beverly Wilson, Sandra Camelo‐Piragua, Nabil Kabbara, Mahjouba Boutarbouch, Derek Hanson, Chad Jacobsen, Karen Wright, Jean M. Mulcahy Levy, Yin Wang, Daniel Catchpoole, Nicolas Gerber, Michael A. Grotzer, Violet Shen, Ashley Plant, Christopher Dunham, Maria João Gil‐da‐Costa, Ramya Ramanujachar, Eric H. Raabe, Jeffery Rubens, Joanna J. Philips, Nalin Gupta, Ahmet Muzaffer Demir, Christine Dahl, Mette Jorgensen, Eugene Hwang, Amy Smith, Enrica E. K. Tan, Sharon Y. Y. Low, Jian‐Qiang Lu, Ho‐Keung Ng, Jesse Kresak, Sridharan Gururangan, Scott L. Pomeroy, Nongnuch Sirachainan, Suradej Hongeng, Vanan Magimairajan, Roona Sinha, Naureen Mushtaq, Reuben Antony, Mariko Sato, David Samuel, Michal Zápotocký, Samina Afzal, Nisreen Amayiri, Maysa Al‐Hussaini, Andrew W. Walter, Tarık Tihan, Gino R. Somers, Amar Gajjar, Paul Wood, Nicolas Gottardo, Jason E. Cain, Peter Downie, Helen M. Branson, Suzanne Laughlin, Birgit Ertl‐Wagner, Derek S. Tsang, Vijay Ramaswamy, James M. Drake, Abhaya V. Kulkarni, David S. Ziegler, Sumihito Nobusawa, Uri Tabori, Michael D. Taylor, George M. Ibrahim, James T. Rutka, Peter B. Dirks, Lili‐Naz Hazrati, Richard G. Grundy, Maryam Fouladi, Pr Laetitia Padovani, Franck Bourdeaut, Jordan R. Hansford, Ute Bartels, Christelle Dufour, Cynthia Hawkins, Nicolás André, Éric Bouffet, Annie Huang

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity Health NetworkCancerCare ManitobaMcMaster UniversityUniversity of British ColumbiaUniversity of AlbertaStollery Children's HospitalIzaak Walton Killam Health CentreAlberta Children's HospitalMcGill UniversityUniversity of OttawaPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of CalgaryChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalSickKids FoundationRoyal University HospitalUniversity of TorontoCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesJunta de Andalucía
Mots-clésMedicineHazard ratioInternal medicineChemotherapyProportional hazards modelBrain tumorOncologyDiseasePhenotypeGastroenterologyPathologyConfidence intervalBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background ETMRs are a newly recognized rare paediatric brain tumor with alterations of the C19MC microRNA locus. Due to varied diagnostic practices and limited clinical data, disease features and determinants of outcome are poorly defined. We performed an integrated clinico-pathologic and molecular analyses of 159 primary ETMRs to define clinical phenotypes, identify predictors of survival and critical treatment modalities for this orphan disease. Methods Primary ETMR patients were identified from the Rare Brain Tumor Consortium (rarebraintumorconsortium.ca) global registry using histopathologic and molecular assays. Event-Free (EFS) and Overall Survival (OS) for 108 patients treated with curative multi-modal regimens were determined using Cox proportional hazard and log rank analyses. Findings ETMRs were predominantly non-metastatic (73%) tumors arising from multiple sites; 55% were cerebral tumors, 45% arose at sites characteristic of other brain tumors. Hallmark C19MC alterations were seen in 91%; 9% were ETMR-NOS. Survival and hazard analyses showed a 6 month median EFS and 2-4yr OS of 27-29% with metastatic disease (HR=0.44, 95% CI 0.26-0.74; p=0.002) and brainstem location (HR=0.40, 95% CI 0.021-0.75; p=0.005) correlating with adverse OS. Gross total resection (GTR: HR=0.38, 95% CI 0.21-0.68; p=0.001), high dose chemotherapy (HDC: HR=0.55, 95% CI 0.31-0.97; p=0.04) and radiation (RT: HR=0.32, 95% CI 0.16-0.60; p=<0.001) correlated with improved EFS and OS in multi-variable analyses. EFS and OS for patients treated with only conventional dose chemotherapy (CC) was 0% and respectively 37%±14% and 32%± 13% for patients treated with HDC. Patients with GTR or sub-total resection (STR) treated with HDC and RT had superior EFS (GTR 73%±14%, p=0.018; STR 67%±19% p=0.009) and OS (GTR 66%±17%, p=0.05; STR 67%±16%, p=0.005). Amongst 21 long-term survivors (OS 24-202 months); 38%, 24% and 24% respectively received craniospinal, focal or no RT. Interpretation Prompt molecular diagnosis and post-surgical treatment with multi-modal therapy tailored to patient-specific risk features improves ETMR survival. Funding This work was supported by the Canadian Institute of Health Research Grant No. 137011, Canada Research Chair Awards to AH. Funds from Miracle Marnie, Phoebe Rose Rocks, Tali’s Funds, Garron Cancer Centre, Grace’s Walk, Meagan’s Walk, Nelina’s Hope and Jean Martel Foundation are gratefully acknowledged. SK and PS were respectively supported by the Australian Lions Children’s Cancer Foundation and the Spanish Society of Pediatrics, Consejería de Salud y Familias de la Junta de Andalucía Project EF-0451-2017.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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