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Enregistrement W3049568243 · doi:10.1111/jfd.13227

VHSV IVb infection and autophagy modulation in the rainbow trout gill epithelial cell line RTgill‐W1

2020· article· en· W3049568243 sur OpenAlexafffund
Juan‐Ting Liu, Phuc H. Pham, Sarah K. Wootton, Niels C. Bols, John S. Lumsden

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of WaterlooUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clésAutophagyBECN1BiologyRainbow troutVirologyWestern blotMicrobiologyCell cultureGeneFish <Actinopterygii>ApoptosisFisheryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy modulation influences the success of intracellular pathogens, and an understanding of the mechanisms involved might offer practical options to reduce the impact of infectious disease. Viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV) can cause high mortality and economic loss in some commercial fish species. VHSV IVb was used to infect a rainbow trout gill cell line, RTgill-W1, followed by the treatment of the cells with different autophagy-modulating reagents. LC3II protein using Western blot was significantly (p < .05) decreased for two days following VHSV infection, and immunofluorescence confirmed that LC3II-positive intracytoplasmic puncta were also decreased. Infection with VHSV resulted in significantly decreased expression of the autophagy-related (Atg) genes atg4, at12, atg13 and becn1 after one day using quantitative PCR. Both viral gene copy number and VHSV N protein were significantly decreased by treating the cells with autophagy-blocking (chloroquine) and autophagy-inhibiting reagents (deoxynivalenol and 3-methyladenine) after three days, while autophagy induction (restricted nutrition and rapamycin) had limited effect. Only treatment of RTgill-W1 with deoxynivalenol resulted in a significant increase in expression of type I interferon. Therefore, the suppression of autophagy initially occurs after VHSV IVb infection, but the modulation of autophagy can also inhibit VHSV IVb infection in RTgill-W1 after three days.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,765
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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