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Enregistrement W3049615823 · doi:10.1016/j.prevetmed.2020.105106

Molecular characteristics and antibiotic susceptibility profiles of Mycoplasma bovis associated with mastitis on dairy farms in China

2020· article· en· W3049615823 sur OpenAlexaff
Yang Liu, Siyu Xu, Mengyue Li, Man Zhou, Wenlin Huo, Jian Gao, Gang Liu, John P. Kastelic, Bo Han

Notice bibliographique

RevuePreventive Veterinary Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Dairy Industry and Technology SystemChina Agricultural UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMastitisBiologyVeterinary medicineTypingMicrobiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycoplasma bovis (M. bovis) is regarded as the most prevalent mycoplasma species causing bovine mastitis worldwide. This study was conducted with the objectives to: (1) estimate M. bovis prevalence in samples from clinical mastitis and bulk tank milk; (2) assess genetic diversity and population structure of isolates; and (3) determine antibiotic susceptibility of isolates to nine antimicrobials. Milk samples (n = 476), including 450 clinical mastitis and 26 bulk tank milk samples from 23 farms (each with >1000 lactating cows) in 10 provinces of China were collected between May 2018 and September 2019. M. bovis cultured from milk samples were analyzed by multi-locus sequence typing. Minimum inhibitory concentrations of all isolates to nine antimicrobials were determined. Differences in minimum inhibitory concentration values were assessed by Kruskal-Wallis test with Bonferroni correction. The positive proportions of M. bovis in clinical mastitis samples and bulk tank milk samples were 39/450 (8.7%) and 11/26 (42.3%), respectively. Based on multi-locus sequence typing, the 50 isolates were identified as three sequence types, including sequence type 10 and two novel sequence types (newly registered as sequence type 172 and sequence type 173). The most prevalent type, sequence type 172 (31/50, 62.0%), had allelic profile 4, 3, 2, 3, 5, 7, 4. In addition, sequence type 10 with allelic profile 4, 3, 2, 3, 5, 3, 4 had a mid-range prevalence (11/50, 22.0%), whereas sequence type 173 with allelic profile 10, 3, 6, 13, 21, 6, 10 was the least prevalent (8/50, 16.0%). Both sequence type 10 and sequence type 172 were clustered in Clonal Complex 3, with isolates from the USA. M. bovis isolates in this study uniformly had low level minimum inhibitory concentrations to enrofloxacin and tiamulin. Overall variances among isolates were significant (Kruskal-Wallis test) for clindamycin (P = 0.006), erythromycin (P = 0.012) and tylosin (P =0.004). Relative to the sequence type 10 group, there were higher minimum inhibitory concentrations levels for the sequence type 173 group (H = -19.795, P = 0.003, for clindamycin; H = -19.574, P = 0.003, for erythromycin; and H = -18.881, P = 0.003, for tylosin) by post-hoc comparisons using pairwise comparisons of mean ranks following Kruskal-Wallis test with Bonferroni correction. Hence, increasing antimicrobial resistance may have contributed to emergence of novel sequence types. These data provided a baseline for elucidating genetic diversity and antibiotic susceptibility profiles of M. bovis in the main dairy-farming provinces in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,865
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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