Travel tales of a worldwide weed: genomic signatures reveal colonial trade routes and prior adaptation are key to the success of Plantago major
Notice bibliographique
Résumé
Retracing pathways of historical species introductions is fundamental to understanding the factors involved in the successful colonization and spread, centuries after a species’ establishment in an introduced range. Numerous plants are thought to have been introduced to regions outside their native ranges by European voyagers and early colonists making transoceanic journeys; however, records are scare to document this. We use genotyping-by-sequencing and genotype-likelihood methods on the selfing, global weed, Plantago major, collected from 50 populations worldwide to test hypotheses that the plant was brought to new regions during colonial times. We further investigate how patterns in genomic diversity facilitate the success of this global weed. Although genomic differentiation among populations is found to be low, we identify six unique ecotypes showing very little sign of admixture. Three of the most prevalent of these ecotypes present in the native range gave rise to introduced populations in the Americas, Africa, Australia and New Zealand, indicating that more than one successful ecotype colonized and spread. The distribution of ecotypes is found to have links to colonial history, and ecotypes are further found to be restricted by latitude. Dispersal of multiple successful ecotypes and prior adaptation in the native range to latitudinally dependent environmental factors (such as climate) are likely reasons for the success of this prolific, global weed. Genomic signatures can provide new perspectives on the drivers behind the historic introductions and the successful colonization of introduced species in an era of global change.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».