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Enregistrement W3049745374 · doi:10.2196/18366

A Systematic Framework for Analyzing Observation Data in Patient-Centered Registries: Case Study for Patients With Depression

2020· article· en· W3049745374 sur OpenAlexvenueno aff
Maryam Zolnoori, Mark D. Williams, William B. Leasure, Kurt B. Angstman, Che Ngufor

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePrimary Care and Health Outcomes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineData qualityData collectionCollaborative CareHealth careIdentification (biology)Data scienceService (business)Computer scienceFamily medicinePrimary care

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Patient-centered registries are essential in population-based clinical care for patient identification and monitoring of outcomes. Although registry data may be used in real time for patient care, the same data may further be used for secondary analysis to assess disease burden, evaluation of disease management and health care services, and research. The design of a registry has major implications for the ability to effectively use these clinical data in research. OBJECTIVE: This study aims to develop a systematic framework to address the data and methodological issues involved in analyzing data in clinically designed patient-centered registries. METHODS: The systematic framework was composed of 3 major components: visualizing the multifaceted and heterogeneous patient-centered registries using a data flow diagram, assessing and managing data quality issues, and identifying patient cohorts for addressing specific research questions. RESULTS: Using a clinical registry designed as a part of a collaborative care program for adults with depression at Mayo Clinic, we were able to demonstrate the impact of the proposed framework on data integrity. By following the data cleaning and refining procedures of the framework, we were able to generate high-quality data that were available for research questions about the coordination and management of depression in a primary care setting. We describe the steps involved in converting clinically collected data into a viable research data set using registry cohorts of depressed adults to assess the impact on high-cost service use. CONCLUSIONS: The systematic framework discussed in this study sheds light on the existing inconsistency and data quality issues in patient-centered registries. This study provided a step-by-step procedure for addressing these challenges and for generating high-quality data for both quality improvement and research that may enhance care and outcomes for patients. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/18366.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,387
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,419
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,387
Score d'incertitude au seuil0,755

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3870,419
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,005
Bibliométrie0,0120,011
Études des sciences et des technologies0,0040,008
Communication savante0,0060,008
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,559
Tête enseignante GPT0,630
Écart entre enseignants0,071 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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