Exploring epidermal mucus protease activity as an indicator of stress in Atlantic sturgeon (<i><scp>Acipenser oxyrinchus</scp> oxyrhinchus</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Atlantic sturgeon are anadromous fish that spend much of their life in near-shore environments. They are designated as "threatened" by the Committee on the Status of Endangered Wildlife in Canada and listed by the IUCN as "near threatened." In Canada, Atlantic sturgeon support small commercial fisheries in the Saint John River, New Brunswick, and the St. Lawrence River, Quebec. While occupying the marine environment, the species is susceptible to various anthropogenic stressors, including by-catch in trawl fisheries and through interactions with coastal engineering projects such as tidal power development. Atlantic sturgeon are also susceptible to implantation of acoustic tags used by researchers to study their movement ecology. These stressors can cause physiological and behavioural changes in the fish that can negatively impact their viability. Because the species are commercially important, and are also of conservation concern, it is important to understand stress responses of Atlantic sturgeon to better mitigate the effects of increased industrial activity in the coastal zone. This study used proteomics to identify and characterize protease activity and identify putative novel protein biomarkers in the epidermal mucus of Atlantic sturgeon. Changes in protein profiles in Atlantic sturgeon epidermal mucus as a result of by-catch and surgery stress were investigated using one-dimensional sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectrometry. Proteolytic activity was identified and characterized using inhibition zymography, which provided information on the classes of proteases that are associated with stress. Samples were collected from Atlantic sturgeon on the Minas Basin, Nova Scotia, Canada, after capture by brush weir and otter trawl, and after surgical implantation of a V16-69 kHz VEMCO acoustic tag. Significant proteins found in the epidermal mucus include various inflammatory proteins, with calmodulin and complement 9 found ubiquitously, and more rarely lysosome C, identified in a brush weir capture sample. Serum albumin, a blood plasma protein, was another ubiquitous protein and verifies how the sample collection method provides a picture of the internal systems. Protease activity was dominantly exhibited by matrix metalloproteases and serine proteases in all sample collections, with serine proteases more active in otter trawl captures than in brush weir captures. By identifying potential protein biomarkers of stress, this study is an example of a non-invasive method for measuring stress in Atlantic sturgeon. Understanding the defence mechanism and release of non-specific biomarkers can be used to improve conservation regulations, as well as to contribute to the limited scientific knowledge on the stress response of Atlantic sturgeon.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».