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Enregistrement W3056228038 · doi:10.1002/gepi.22331

Dissecting the genetic overlap of smoking behaviors, lung cancer, and chronic obstructive pulmonary disease: A focus on nicotinic receptors and nicotine metabolizing enzyme

2020· article· en· W3056228038 sur OpenAlex
Michael J. Bray, Li‐Shiun Chen, Louis Fox, Dana B. Hancock, Robert Culverhouse, Sarah M. Hartz, Eric O. Johnson, Mengzhen Liu, James McKay, Nancy L. Saccone, John E. Hokanson, Scott Vrieze, Rachel F. Tyndale, Timothy B. Baker, Laura J. Bierut

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetic Epidemiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSmoking Behavior and Cessation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Mental HealthNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Human Genome Research InstituteDepartment of Education and TrainingWorld Health Organization
Mots-clésLung cancerCOPDCYP2A6Smoking cessationMedicineInternal medicineNicotineLinkage disequilibriumOncologySingle-nucleotide polymorphismGenotypeGeneticsPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Smoking is a major contributor to lung cancer and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Two of the strongest genetic associations of smoking‐related phenotypes are the chromosomal regions 15q25.1, encompassing the nicotinic acetylcholine receptor subunit genes CHRNA5‐CHRNA3‐CHRNB4 , and 19q13.2, encompassing the nicotine metabolizing gene CYP2A6 . In this study, we examined genetic relations between cigarettes smoked per day, smoking cessation, lung cancer, and COPD. Data consisted of genome‐wide association study summary results. Genetic correlations were estimated using linkage disequilibrium score regression software. For each pair of outcomes, z‐score‐z‐score (ZZ) plots were generated. Overall, heavier smoking and decreased smoking cessation showed positive genetic associations with increased lung cancer and COPD risk. The chromosomal region 19q13.2, however, showed a different correlational pattern. For example, the effect allele‐C of the sentinel SNP (rs56113850) within CYP2A6 was associated with an increased risk of heavier smoking ( z ‐score = 19.2; p = 1.10 × 10 −81 ), lung cancer ( z ‐score = 8.91; p = 5.02 × 10 −19 ), and COPD ( z ‐score = 4.04; p = 5.40 × 10 −5 ). Surprisingly, this allele‐C (rs56113850) was associated with increased smoking cessation ( z ‐score = −8.17; p = 2.52 × 10 −26 ). This inverse relationship highlights the need for additional investigation to determine how CYP2A6 variation could increase smoking cessation while also increasing the risk of lung cancer and COPD likely through increased cigarettes smoked per day.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,832

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle