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Enregistrement W3056601423 · doi:10.1016/j.mex.2020.101023

Semi-automated segmentation of the lateral periventricular regions using diffusion magnetic resonance imaging

2020· article· en· W3056601423 sur OpenAlexaff
Albert M. Isaacs, Rowland H. Han, Christopher D. Smyser, David D. Limbrick, Joshua S. Shimony

Notice bibliographique

RevueMethodsX · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal and fetal brain pathology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthMarch of Dimes Prematurity Research Center Ohio CollaborativeDoris Duke Charitable FoundationChild Neurology FoundationCerebral Palsy International Research FoundationDana FoundationNational Institutes of HealthMarch of Dimes Foundation
Mots-clésCerebrospinal fluidMagnetic resonance imagingDiffusion MRIBiomedical engineeringSIGNAL (programming language)Ventricular systemHydrocephalusWhite matterVoxelMedicineMaterials scienceComputer sciencePathologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lateral ventricular perimeter (LVP) of the brain is a critical region because in addition to housing neural stem cells required for brain development, it facilitates cerebrospinal fluid (CSF) bulk flow and functions as a blood-CSF barrier to protect periventricular white matter (PVWM) and other adjacent regions from injurious toxins. LVP injury is common, particularly among preterm infants who sustain intraventricular hemorrhage or post hemorrhagic hydrocephalus and has been associated with poor neurological outcomes. Assessment of the LVP with diffusion MRI has been challenging, primarily due to issues with partial volume artifacts since the LVP region is in close proximity to CSF and other structures of varying signal intensities that may be inadvertently included in LVP segmentation. This research method presents: •A novel MATLAB-based method to segment a homogenous LVP layer using high spatial resolution parameters (voxel size 1.2 × 1.2 × 1.2 mm 3 ) to only capture the innermost layer of the LVP. •The segmented LVP is averaged from three contiguous axial slices to increase signal to noise ratio and reduce the effect of any residual volume averaging effect and eliminates manual and inter/intrarater-related errors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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