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Enregistrement W3065101582 · doi:10.1007/s11104-020-04655-5

Soil inoculation alters the endosphere microbiome of chrysanthemum roots and leaves

2020· article· en· W3065101582 sur OpenAlexfundno aff
Nurmi Pangesti, Ana Pineda, S. Emilia Hannula, Т. Martijn Bezemer

Notice bibliographique

RevuePlant and Soil · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNederlands Instituut voor EcologieGénome QuébecNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekKoninklijke Nederlandse Akademie van WetenschappenMcGill University
Mots-clésBiologyInoculationThripsPlant physiologyMicrobiomeBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aims This study examines how inoculation with live soil influences the assembly of the endosphere microbiome of leaves and roots of chrysanthemum. Methods Sterilized soil was inoculated with 10% soil in which grasses had grown. Chrysanthemum was planted in these soils and control plants were grown in 100% sterilized soil. All plants were exposed to thrips, and leaves and roots were collected from inoculated and control plants that experienced high and low thrips damage. DNA was extracted and the bacterial and fungal community inside roots and leaves was determined using Illumina sequencing. Results Inoculation increased bacterial diversity in root but not in leaf tissues. The endosphere of both roots and leaves was dominated by Pseudomonadaceae. In leaves, the relative abundance of Pseudomonadaceae was higher in inoculated than in control plants, whereas this was opposite in roots. Leaves contained more rare bacterial families than roots. The number of fungal reads was very low and the endopshere did not differ between plants with high or low thrips damage. Conclusions Bacterial communities inside chrysanthemum root and leaf tissues differ considerably. Soil inoculation with entire microbiomes can be used to change root and foliar bacterial microbiomes and this is particularly effective in root tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,660
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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